R语言连接MYSQL

 

操作系统：centos 6.4 64bit

 

R语言可以使用RMySQL来连接Mysql数据库，直接使用数据库里面的数据生成图像。

 

这个是RMYSQL的说明：

http://cran.r-project.org/web/packages/RMySQL/index.html

RMYSQL的依赖：

Depends:R (≥ 2.8.0), methods, DBI (≥ 0.2-2), utils

 

当然了，你得安装好mysql，至少安装mysqlclient，这个在本文就不描述了，网上很多。

 

根据前面的一篇R语言安装文章：http://hi.baidu.com/solohac/item/4a18e78f1bef9b5825ebd99c

我安装的是/R-3.1.0，所以只要再安装DBI就可以了。

如果你不知道版本，进入R命令行输入：version

 

打开R命令行，输入：

1	install.packages("DBI")

安装DBI完毕

 

 

安装RMySQL输入：

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install.packages("RMySQL")   ** libs gcc -std=gnu99 -I/usr/local/lib64/R/include -DNDEBUG -I/usr/include/mysql -I/usr/local/include    -fpic  -g -O2  -c RS-DBI.c -o RS-DBI.o gcc -std=gnu99 -I/usr/local/lib64/R/include -DNDEBUG -I/usr/include/mysql -I/usr/local/include    -fpic  -g -O2  -c RS-MySQL.c -o RS-MySQL.o gcc -std=gnu99 -shared -L/usr/local/lib64 -o RMySQL.so RS-DBI.o RS-MySQL.o -lmysqlclient -lz installing to /usr/local/lib64/R/library/RMySQL/libs ** R ** inst ** preparing package for lazy loading Creating a generic function for ‘format’ from package ‘base’ in package ‘RMySQL’ Creating a generic function for ‘print’ from package ‘base’ in package ‘RMySQL’ ** help *** installing help indices ** building package indices ** testing if installed package can be loaded * DONE (RMySQL)   The downloaded source packages are in ‘/tmp/Rtmp1gnlCs/downloaded_packages’ Updating HTML index of packages in '.Library' Making 'packages.html' ... done

到此，RMySQL安装完毕。

 

【另外】

如果你安装失败了，有如下提示：

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Configuration error:   could not find the MySQL installation include and/or library   directories.  Manually specify the location of the MySQL   libraries and the header files and re-run R CMD INSTALL.

 

则说明找不到Mysql头文件和库，需要把mysqlclient安装到这下面（我是64bit系统）

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[root@localhost ~]# ls /usr/lib64/mysql libmysqlclient_r.so     libmysqlclient_r.so.16.0.0  libmysqlclient.so.16      libmysqld.so    libmysqld.so.0.0.1  mysql_config libmysqlclient_r.so.16  libmysqlclient.so           libmysqlclient.so.16.0.0  libmysqld.so.0  mysqlbug            plugin

 

下面演示RMySQL的使用（当然，数据库你得自己建，数据你得自己生成）：

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> library(RMySQL) Loading required package: DBI > > mysql<-dbConnect(MySQL(), dbname="yourdbname", username="root", password="solohac"  ) > count<-dbGetQuery(mysql, "select count(*) from logs") > count   count(*) 1     4676