linux命令行下使用R语言绘图
系统：centos 6.4 64bit
环境安装参考：http://hi.baidu.com/solohac/item/4a18e78f1bef9b5825ebd99c
在R语言中可以使用png()等函数生成图片，例如： png("aa.png")可以生成图片。
但是如果你是通过shell远程连接到系统上，可能会碰到如下错误：
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> png("aa.png")错误于.External2(C_X11, paste("png::", filename, sep = ""), g$width, : 无法打开PNG设备此外: 警告信息：In png("aa.png") : 无法打开链结到X11显示'' |
分析：
打开R控制台，输入capabilities()，可以看到：
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> capabilities() jpeg png tiff tcltk X11 aqua http/ftp sockets FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE libxml fifo cledit iconv NLS profmem cairo TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE |
可以看到png为false，因为生成图片需要X11，但是shell是没有X11的。
怎么解决：
1.在X11模式下执行R语言命令，也就是在linux的桌面。如果你只是在桌面上画画图，那选择这个方式就可以了。
2.不使用X11生成,使用 图形渲染库Cairo。比如我，需要用脚本，根据实时数据生成统计图，那么用这个方式就很方便。
安装：
启动R控制台
R
安装
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install.packages("Cairo") |
会让你选择安装镜像
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--- 在此連線階段时请选用CRAN的鏡子 ---CRAN mirror 1: 0-Cloud 2: Argentina (La Plata) 3: Argentina (Mendoza) 4: Australia (Canberra) 5: Australia (Melbourne) 6: Austria 7: Belgium 8: Brazil (BA) 9: Brazil (PR) 10: Brazil (RJ) 11: Brazil (SP 1) 12: Brazil (SP 2) 13: Canada (BC) 14: Canada (NS) 15: Canada (ON) 16: Canada (QC 1) 17: Canada (QC 2) 18: Chile 19: China (Beijing 1) 20: China (Beijing 2) 选一个北京的好了：20 |
安装出错
configure: error: Cannot find cairo.h! Please install cairo (http://www.cairographics.org/) and/or set CAIRO_CFLAGS/LIBS correspondingly.
所以我们需要先在系统中安装cairo库
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yum -y install cairo* libxt*安装完成之后，重新执行：install.packages("Cairo")installing to /usr/local/lib64/R/library/Cairo/libs** R** preparing package for lazy loading** help*** installing help indices** building package indices** testing if installed package can be loaded* DONE (Cairo)下载的程序包在‘/tmp/RtmpNlGyf3/downloaded_packages’里更新'.Library'里的HTML程序包列表Making 'packages.html' ... 做完了。 |
安装成功。
加载Cairo后，查看支持：
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> library(Cairo)> Cairo.capabilities() png jpeg tiff pdf svg ps x11 win raster TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE 说明已经支持用cairo生成图片了。例如可以使用如下命令生成PNG：CairoPNG(file="out.png",width=800,height=480) |
附上一个测试小程序，主要为了说明用法：
#vim test.r
library(Cairo)
CairoPNG(file="out.png",width=800,height=480)
plot(5,4)
保存后执行：
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[root@localhost ~]# Rscript test.r R version 3.1.0 (2014-04-10) -- "Spring Dance"Copyright (C) 2014 The R Foundation for Statistical ComputingPlatform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)> library(Cairo)> CairoPNG(file="out.png",width=800,height=480)> plot(5,4)> |
在当前目录下可以看到生成了图片
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[root@localhost ~]# ll总用量 84-rw-r--r--. 1 root root 6832 5月 13 10:33 out.png-rw-r--r--. 1 root root 71 5月 13 10:32 test.r |
