Deakin HPC使用教程

1. 常用指令

1.1 SLUM常用指令

• 查看机器：sinfo
• 连接机器交互式执行命令mem：srun -p mem --pty bash
• 提交脚本直接运行： srun -p mem python test.py
• 编写sh文件后提交：sbatch run.sh
  优点：1.可批量运行脚本；2.关闭窗口后不影响提交排队运行
  run.sh文件内容：

#!/bin/bash

#SBATCH --partition=mem
#SBATCH --mail-type=ALL
#SBATCH --mail-user=panxinhao98@gmail.com
#SBATCH -o output.txt
#SBATCH -e bug.txt

source activate luto2
python test.py

• 查看所有人使用情况：squeue -a
• 取消提交的命令： scancel #JOBID

1.2 Linux常用指令

• 查看运行内存：free -h
• 查看内存使用情况：top后
  l：切换显示平均负载和启动时间信息；
  m：切换显示内存信息；
  t：切换显示进程和CPU状态信息；
  c：切换显示命令名称和完整命令行；
  M：根据驻留内存大小进行排序；
  P：根据CPU使用百分比大小进行排序；
  T：根据时间/累计时间进行排序；
  q: 退出

1.3 Vim常用指令

• 用户刚刚启动 vi/vim，便进入了命令模式：
  i 切换到输入模式，在光标当前位置开始输入文本。
  :w 保存文件。
  :q 退出 Vim 编辑器。
  :q! 强制退出Vim 编辑器，不保存修改
• 输入模式
  在命令模式下按下 i 就进入了输入模式，使用 Esc 键可以返回到普通模式
• 底线命令模式
  在命令模式下按下 :（英文冒号）就进入了底线命令模式
  w：保存文件。
  :q：退出 Vim 编辑器。
  :wq：保存文件并退出 Vim 编辑器。
  :q!：强制退出Vim编辑器，不保存修改。

2. 安装可以运行LUTO2的python环境

2.1 安装任意一个anaconda环境

2.2 执行以下代码，创建虚拟环境用于运行LUTO2

conda remove --name luto2 --all

conda create --name luto2 python=3.10

source activate luto2

cd /home/s222552331/LUTO2_XH/LUTO2 # 存放temp_requirements.txt的路径

pip install -r temp_requirements.txt

pip install gurobipy-9.5.2-cp310-cp310-win_amd64.whl # 用于windows平台

python -m pip install --find-links /home/s222552331/LUTO2_XH/LUTO2 --no-index gurobipy #用于linux平台

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本文作者：skypanxh
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