Ubuntu16.04安装配置Caffe教程(GPU版)

推荐博客:https://www.linuxidc.com/Linux/2017-11/148629.htm
https://blog.csdn.net/yggaoeecs/article/details/79163789


此教程主要借鉴自:

GPU版:http://www.linuxidc.com/Linux/2016-12/138870.htm

CPU版:http://www.linuxidc.com/Linux/2016-09/135034.htm

 
1   电脑配置及软件说明

1)     Ubuntu 16.04 x64系统,GPU:Quadro M4000(提示:在linux下可以通过命令lspic | grep –i vga 查看)

2)     Caffe:Convolutional Architecture for Fast FeatureEmbedding

3)     NVIDIA显卡驱动(不同的GPU对应不同的版本)

4)     CUDA 9.0

5)     cuDNN v7.0.5 for CUDA 9.0

6)     OpenCV 3.2.0

 
2          安装NVIDIA GPU驱动
2.1         查询GPU驱动

首先去NVIDIA官网http://www.nvidia.com/Download/index.aspx?lang=en-us查看适合自己显卡的驱动并下载。如下图1,图2所示。

图1. 填写GPU和系统信息

图2. 搜索结果

       本文中显卡型号是Quadro M4000,系统linux 64-bit,按照要求点击serach出现图2所示搜索结果,点击下载。本文中下载的驱动文件是:NVIDIA-Linux-x86_64-384.111.run。

注意:我们要把这个文件放到英文目录(e.g. /home)下,原因是下面我们要切换到文字界面下,如果放到中文目录下,我们没有办法进入这个目录(没有中文输入法,且中文全部是乱码)。
2.2         安装GPU驱动
2.2.1         屏蔽自带显卡驱动

1) 在终端下输入: sudo gedit /etc/modprobe.d/blacklist.conf

2) 输入密码收在最后一行加上:blacklist nouveau. 这里是将Ubuntu自带的显卡驱动加入黑名单

3) 在终端输入:sudo update-initramfs –u,使修改生效

4) 重启电脑
2.2.2         安装新驱动

1) 启动电脑后,按Ctrl+Alt+F1~F6进入命令行界面(安装GPU驱动要求在命令行环境),输入用户名和密码进入用户目录

2) 输入命令:sudo service lightdm stop

3) 进入驱动所在的文件夹,sudo chmod +x ./NVIDIA-Linux-x86_64-384.111.run,修改权限。然后:sudo ./NVIDIA-Linux-x86_64-384.111.run,进入安装程序

4) 完成安装后,重启电脑

5) 重启电脑后,输入以下指令进行验证:sudo nvidia-smi,若列出了GPU的信息列表则表示驱动安装成功。如下图3所示。

图3. GPU信息列表
3          安装CUDA

CUDA是NVIDIA的编程语言平台,想使用GPU就必须要使用cuda。

(1)   下载CUDA

首先在官网上https://developer.nvidia.com/cuda-downloads下载CUDA。下载CUDA时一定要注意CUDA和NVIDIA显卡驱动的适配性。现在的情况是:CUDA_8.0支持375.**及以上系列的显卡驱动;CUDA_9.0支持384.**及以上系列的显卡驱动;CUDA_9.1支持389.**及以上系列的显卡驱动。本文中的显卡驱动为384.111系列,所以不能下载最新版本的CUDA_9.1,最后下载的是cuda_9.0.176_384.81_linux.run(当然,CUDA_8.0也是没问题的)。下载界面如下图4所示。

图4. CUDA_9.0下载界面

(2)   运行安装程序

执行以下命令:

sudo chmod 777 cuda_9.0.176_384.81_linux.run

sudo ./cuda_9.0.176_384.81_linux.run

注意:执行后会有一系列提示让你确认,但是注意,有个让你选择是否安装nvidia384驱动时,一定要选择否:Install NVIDIA Accelerated Graphics Driver for Linux-x86_64 384.**?

因为前面我们已经安装了更加新的nvidia384,所以这里不要选择安装。其余的都直接默认或者选择是即可。

(3)   环境变量设置

打开~/.bashrc文件:sudo gedit ~/.bashrc

将以下内容写入到~/.bashrc尾部:

exportPATH=/usr/local/cuda-9.0/bin${PATH:+:${PATH}}

exportLD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda/lib64${LD_LIBRARY_PATH:+:${LD_LIBRARY_PATH}}

(4)    测试CUDA是否安装成功

执行以下命令:

cd /usr/local/cuda-8.0/samples/1_Utilities/deviceQuery

sudo make

sudo ./deviceQuery

如果显示一些关于GPU的信息,则说明安装成功。如下图5所示。

图5. CUDA测试信息
4          配置cuDNN

cuDNN是GPU加速计算深层神经网络的库。

(1)   首先去官网 https://developer.nvidia.com/rdp/cudnn-download 下载cuDNN,需要注册一个账号才能下载。下载cuDNN时也一定要注意与CUDA版本的适配性,此信息官网中已经给的很清楚。下载界面如下图6所示。

图6. cuDNN下载界面

(2)   下载cuDNN后进行解压:sudo tar -zxvf ./cudnn-9.0-linux-x64-v7.tgz

(3)   进入解压后的文件夹下的include目录,在命令行进行如下操作:

cd cuda/include

sudo cp cudnn.h/usr/local/cuda/include  #复制头文件到cuda头文件目录

(4)   进入lib64目录下,对动态文件进行复制和软链接

cd ..

cd lib64

sudo cp lib*/usr/local/cuda/lib64/    #复制动态链接库

cd /usr/local/cuda/lib64/

sudo rm -rf libcudnn.solibcudnn.so.7    #删除原有动态文件

sudo ln -s libcudnn.so.7.0.5libcudnn.so.7  #生成软衔接

sudo ln -s libcudnn.so.7libcudnn.so      #生成软链接
5          安装OpenCV3.2

详细的安装请参考:http://www.linuxidc.com/Linux/2017-07/145446.htm

(1)   从官网(http://opencv.org/downloads.html)下载Opencv,并将其解压到你要安装的位置,假设解压到了/home/opencv。

unzip opencv-3.2.0.zip

sudo cp ./opencv-3.2.0 /home/username

sudo mv opencv-3.2.0 opencv

 

(2)   安装前准备,创建编译文件夹

cd ~/opencv

mkdir build

cd build

 

(3)   配置

sudo apt install cmake

sudo cmake -D CMAKE_BUILD_TYPE=Release -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr/local ..

 

(4)   编译

sudo make -j8 (-j8表示并行计算,根据自己电脑的配置进行设置,配置比较低的电脑可以将数字改小或不使用,直接输make)

 

(5)   安装

以上只是将opencv编译成功,还没将opencv安装,需要运行下面指令进行安装:

sudo make install
6          配置Caffe

(1)   安装相关依赖

sudoapt-get install libprotobuf-dev libleveldb-dev libsnappy-dev libopencv-devlibhdf5-serial-dev protobuf-compiler

sudoapt-get install --no-install-recommends libboost-all-dev

sudoapt-get install libopenblas-dev liblapack-dev libatlas-base-dev

sudoapt-get install libgflags-dev libgoogle-glog-dev liblmdb-dev

上面有些命令是不对嘚用下面嘚:参考博客:https://www.cnblogs.com/go-better/p/7161006.html

1 sudo apt-get install libprotobuf-dev libleveldb-dev libsnappy-dev libopencv-dev libhdf5-serial-dev protobuf-compiler
2 sudo apt-get install --no-install-recommends libboost-all-dev
3 sudo apt-get install libopenblas-dev liblapack-dev libatlas-base-dev
4 sudo apt-get install libgflags-dev libgoogle-glog-dev liblmdb-dev



(2)   下载Caffe

使用Git直接下载Caffe非常简单,或者去https://github.com/BVLC/caffe下载。

下载完成后,会在家目录下的下载里找到caffe-master.zip,用unzip命令解压到家目录下,然后重命名为caffe。

 

(3)   修改Makefile.config

因为make指令只能make Makefile.config文件,而Makefile.config.example是caffe给出的makefile例子。因此,首先将Makefile.config.example的内容复制到Makefile.config:

sudo cpMakefile.config.example Makefile.config

打开并修改配置文件:

sudogedit Makefile.config #打开Makefile.config文件 根据个人情况修改文件:

a.      若使用cudnn,则将

#USE_CUDNN:= 1

修改成:

USE_CUDNN:= 1

b.      若使用的opencv版本是3的,则将

#OPENCV_VERSION:= 3

修改为:

OPENCV_VERSION:= 3

c.      若要使用python来编写layer,则将

#WITH_PYTHON_LAYER:= 1

修改为WITH_PYTHON_LAYER := 1

d.      重要的一项,将

#Whatever else you find you need goes here. 下面的

INCLUDE_DIRS:= $(PYTHON_INCLUDE) /usr/local/include

LIBRARY_DIRS:= $(PYTHON_LIB) /usr/local/lib /usr/lib

修改为:

INCLUDE_DIRS:= $(PYTHON_INCLUDE) /usr/local/include /usr/include/hdf5/serial

LIBRARY_DIRS:= $(PYTHON_LIB) /usr/local/lib /usr/lib /usr/lib/x86_64-linux-gnu/usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial      

这是因为Ubuntu16.04的文件包含位置发生了变化,尤其是需要用到的hdf5的位置,所以需要更改这一路径。

 

(4)   修改Makefile文件

打开Makefile文件,做如下修改,将:

NVCCFLAGS +=-ccbin=$(CXX) -Xcompiler-fPIC$(COMMON_FLAGS)

替换为:

NVCCFLAGS += -D_FORCE_INLINES -ccbin=$(CXX)-Xcompiler -fPIC $(COMMON_FLAGS)

 

(5)   编辑/usr/local/cuda/include/host_config.h

将其中的第115行注释掉,将

#error-- unsupported GNU version! gcc versionslater than 4.9 are not supported!

改为:

//#error-- unsupported GNU version! gcc versionslater than 4.9 are not supported!

 

(6)   编译

make all -j8  #-j根据自己电脑配置决定

如果出现错误:

Unsupported gpu architecture 'compute_20'

    CUDA_ARCH := #-gencode arch=compute_20,code=sm_20 \
    #-gencode arch=compute_20,code=sm_21 \
    -gencode arch=compute_30,code=sm_30 \
    -gencode arch=compute_35,code=sm_35 \
    -gencode arch=compute_50,code=sm_50 \
    -gencode arch=compute_52,code=sm_52 \
    -gencode arch=compute_60,code=sm_60 \
    -gencode arch=compute_61,code=sm_61 \
    -gencode arch=compute_61,code=compute_61

不支持compute_20 即把compute_20 所在行注释掉,然后make clean,重新make

如果出现 错误 1(make: Nothing to be done for 'pycaffe'.)解决方法

$ sudo make clean

之后运行

$ sudo make pycaffe

如果出现 错误 2fatal error: numpy/arrayobject.h没有那个文件或目录

其实numpy已经是安装的,anaconda2里面有,python中import numpy也没有问题,但就是在此处报错,解决方法:

 sudo apt-get install python-numpy

然后

 sudo make pycaffe -j16

pycaffe就编译成功了


(7)   测试

sudo make runtest

如果运行之后出现下图7所示,说明caffe配置成功。

如果出现下面错位:make: .build_release/tools/caffe:命令未找到

参考博客:https://stackoverflow.com/questions/43515617/caffe-error-while-loading-shared-libraries-libcudnn-so-5-cannot-open-shared-o

https://blog.csdn.net/yunyi4367/article/details/78070928?locationNum=4&fps=1

解决办法是使用命令打开环境变量sudo gedit ~/.bashrc后面添加参考博客一嘚第一句话 1. export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda-8.0/lib64:$LD_LIBRARY_PATH

图7. Caffe测试成功运行结果

 


7          MNIST数据集测试

配置caffe完成后,我们可以利用MNIST数据集对caffe进行测试,过程如下:

1.将终端定位到Caffe根目录

cd ~/caffe

 

2.下载MNIST数据库并解压缩

./data/mnist/get_mnist.sh

 

3.将其转换成Lmdb数据库格式

./examples/mnist/create_mnist.sh

 

4.训练网络

./examples/mnist/train_lenet.sh

训练的时候可以看到损失与精度数值,如下图8所示:


 

 

 

 

 

 

 

 

下面这个博客也不错嘚!

https://www.cnblogs.com/go-better/p/7161006.html

Ubuntu16.04 14.04安装配置Caffe(GPU版)

caffe配置过程很长啊,坑非常多,没有linux基础的估计会香菇的。我参考了网上很多的帖子,基本上每个帖子都有或多或少的问题,研究很久最终配置成功。参考过的帖子太多,都记不太清来源了。为了对前人的感谢,特地写下我的配置过程,以供大家参考。可能我写的时候会有遗漏,还望多多包涵,共同探讨!

1. 安装相关依赖项

1 sudo apt-get install libprotobuf-dev libleveldb-dev libsnappy-dev libopencv-dev libhdf5-serial-dev protobuf-compiler
2 sudo apt-get install --no-install-recommends libboost-all-dev
3 sudo apt-get install libopenblas-dev liblapack-dev libatlas-base-dev
4 sudo apt-get install libgflags-dev libgoogle-glog-dev liblmdb-dev

2.安装NVIDIA驱动

(1) 查询NVIDIA驱动

首先去官网 http://www.nvidia.com/Download/index.aspx?lang=en-us 查看适合自己显卡的驱动(这里不要下载,用下载的驱动安装可能会出现循环登陆问题)

点击右边的search进入下载页面

可以看到我的显卡支持375

(2)安装驱动

在终端下输入:

 

sudo apt-get purge nvidia-*  //这是卸载以前的nvidia驱动
sudo add-apt-repository pa:graphics-drivers/ppa
sudo apt-get update
sudo apt-get install nvidia-375
reboot //重启

完成后,电脑重启

安装完成之后输入以下指令进行验证:

sudo nvidia-smi

若列出了GPU的信息列表则表示驱动安装成功。如下图:

3.安装CUDA

(1)下载CUDA

首先在官网上(https://developer.nvidia.com/cuda-downloads)下载CUDA:

2)下载完成后执行以下命令(我用的是cuda7.5):

1 sudo chmod 777 cuda_7.5.44_linux.run
2 sudo  ./cuda_7.5.44_linux.run

注意:执行后会有一系列提示让你确认,但是注意,有个让你选择是否安装nvidia367驱动时,一定要选择否:
Install NVIDIA Accelerated Graphics Driver for Linux-x86_64 367.48?
因为前面我们已经安装了更加新的nvidia367,所以这里不要选择安装。其余的都直接默认或者选择是即可。

3)环境变量配置

打开~/.bashrc文件:

sudo gedit ~/.bashrc

将以下内容写入到~/.bashrc尾部:

export PATH=/usr/local/cuda-7.5/bin${PATH:+:${PATH}}
export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda-7.5/lib64${LD_LIBRARY_PATH:+:${LD_LIBRARY_PATH}}

/etc/profile文件中添加CUDA环境变量:

sudo gedit /etc/profile

打开文档都在文档结尾加上下面两句:

1 PATH=/usr/local/cuda/bin:$PATH  
2 export PATH

保存后, 执行下列命令, 使环境变量立即生效:

source /etc/profile

同时添加lib库路径,在 /etc/ld.so.conf.d/新建文件 cuda.conf

sudo gedit /etc/ld.so.conf.d/cuda.conf

在文中加入下面内容:

/usr/local/cuda/lib64

执行下列命令使之立刻生效:

sudo ldconfig

(4)测试CUDA的samples

1 cd /usr/local/cuda-7.5/samples/1_Utilities/deviceQuery
2 make
3 sudo ./deviceQuery

如果显示一些关于GPU的信息,则说明安装成功。

nvcc –V 命令可查看版本

4.配置cuDNN(感觉我的有问题,我暂时没用这个,另外这个单独写了个教程)

cuDNN是GPU加速计算深层神经网络的库。

首先去官网 https://developer.nvidia.com/rdp/cudnn-download 下载cuDNN,需要注册一个账号才能下载。

我直接在网上下的cuda7.5的cudnn-7.5-linux-x64-v5.0.tgz

进行解压:

sudo tar -zxvf ./cudnn-7.5-linux-x64-v5.0.tgz

进入cuDNN5.0解压之后的include目录,在命令行进行如下操作:

1 cd cuda/include
2 sudo cp cudnn.h /usr/local/cuda/include  #复制头文件

再将进入lib64目录下的动态文件进行复制和链接:

复制代码
1 cd ..
2 cd lib64
3 sudo cp lib* /usr/local/cuda/lib64/    #复制动态链接库
4 cd /usr/local/cuda/lib64/
5 sudo chmod +r libcudnn.so.5.0.5
6 sudo ln -sf libcudnn.so.5.0.5 libcudnn.so.5
7 sudo ln -sf libcudnn.so.5 libcudnn.so
8 sudo ldconfig
复制代码

5.安装opencv3.1

从官网(http://opencv.org/downloads.html)下载Linux版Opencv

并将其解压到你要安装的位置,假设解压到了/home/opencv

1 unzip opencv-3.1.0.zip
2 sudo cp ./opencv-3.1.0 /home
3 sudo mv opencv-3.1.0 opencv

安装前准备,创建编译文件夹:

1 cd ~/opencv
2 mkdir build
3 cd build

配置:

1 sudo apt install cmake
2 sudo cmake -D CMAKE_BUILD_TYPE=Release -D CMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr/local ..

编译:

sudo make -j8 

-j8表示并行计算,根据自己电脑的配置进行设置,配置比较低的电脑可以将数字改小或不使用,直接输make。

以上只是将opencv编译成功,还没将opencv安装,需要运行下面指令进行安装:

sudo make install

测试opencv:

1 mkdir ~/opencv-test  
2 cd ~/opencv-test  
3 gedit DisplayImage.cpp  

编辑如下代码:

复制代码
 1 #include <stdio.h>  
 2 #include <opencv2/opencv.hpp>  
 3 using namespace cv;  
 4 int main(int argc, char** argv )  
 5 {  
 6     if ( argc != 2 )  
 7     {  
 8         printf("usage: DisplayImage.out <Image_Path>\n");  
 9         return -1;  
10     }  
11     Mat image;  
12     image = imread( argv[1], 1 );  
13     if ( !image.data )  
14     {  
15         printf("No image data \n");  
16         return -1;  
17     }  
18     namedWindow("Display Image", WINDOW_AUTOSIZE );  
19     imshow("Display Image", image);  
20     waitKey(0);  
21     return 0;  
22 }  
复制代码

创建CMake编译文件:

gedit CMakeLists.txt

写入如下内容:

cmake_minimum_required(VERSION 2.8)  
project( DisplayImage )  
find_package( OpenCV REQUIRED )  
add_executable( DisplayImage DisplayImage.cpp )  
target_link_libraries( DisplayImage ${OpenCV_LIBS} )  

编译:

1 cd ~/opencv-test  
2 cmake .  
3 make 

执行:

此时opencv-test文件夹中已经产生了可执行文件DisplayImage,随便从网上下载一张图片放在opencv-test文件夹下,此处下载了opencv.jpg,然后运行:

./DisplayImage opencv.jpg

结果是显示我下载的这张图像。

 如果想用python调用opencv,安装python-opencv:

1 sudo apt-get install python-opencv  
2 sudo apt-get install python-numpy

打开python,import即可。

Ps:如果用cuda8.0,可能会出现以下错误:

这是因为opecv3.0与cuda8.0不兼容导致的。解决办法:修改 ~/opencv/modules/cudalegacy/src/graphcuts.cpp文件内容,如图:

 

其中

#if !defined (HAVE_CUDA) || defined (CUDA_DISABLER)||(CUDART_VERSION>=8000)

是我们修改的。

 6.配置caffe

(1)https://github.com/BVLC/caffe下载caffe

下载完成后,会在家目录下的下载里找到caffe-master.zip,用unzip命令解压到家目录下,然后重命名为caffe.

2)复制Makefileconfig

sudo cp Makefile.config.example Makefile.config

3)打开并修改配置文件:

sudo gedit Makefile.config #打开Makefile.config文件 

根据个人情况修改文件:

a.若使用cudnn,则

#USE_CUDNN := 1

修改成:

USE_CUDNN := 1

b.若使用的opencv版本是3的,则

#OPENCV_VERSION := 3 

修改为:

OPENCV_VERSION := 3

c.若要使用python来编写layer,则

#WITH_PYTHON_LAYER := 1 

修改为

WITH_PYTHON_LAYER := 1

d.重要的一项 :

将# Whatever else you find you need goes here. 下面的

1 INCLUDE_DIRS := $(PYTHON_INCLUDE) /usr/local/include
2 LIBRARY_DIRS := $(PYTHON_LIB) /usr/local/lib /usr/lib

修改为:

1 INCLUDE_DIRS := $(PYTHON_INCLUDE) /usr/local/include /usr/include/hdf5/serial
2 LIBRARY_DIRS := $(PYTHON_LIB) /usr/local/lib /usr/lib /usr/lib/x86_64-linux-gnu /usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial  

4)修改makefile文件

打开makefile文件,做如下修改:(这个不知道有没有用,这一步感觉没作用)
将:

NVCCFLAGS +=-ccbin=$(CXX) -Xcompiler-fPIC $(COMMON_FLAGS)

替换为:

NVCCFLAGS += -D_FORCE_INLINES -ccbin=$(CXX) -Xcompiler -fPIC $(COMMON_FLAGS)

接下来是针对安装opencv3.0.0版本的同学而言的,对于3.0.0之前的版本不需要修改:

在位置((LIBRARIES+= glog gflags protobuf leveldb snappy lmdbboost_system hdf5_hl hdf5 m 
opencv_coreopencv_highgui opencv_imgproc opencv_imgcodecs))处添加opencv_imgcodecs

这一步非常重要,否则编译后会出现错误如下:

CXX/LD-o.build_release/tools/convert_imageset.bin
.build_release/lib/libcaffe.so:undefined reference tocv::imread(cv::String const&,int)'.build_release/lib/libcaffe.so: undefined referencetocv::imencode(cv::String const&, cv::_InputArray const&,std::vector >&, std::vector > const&)'

原因就是opencv3.0.0把imread相关函数放到imgcodecs.lib中了,而非原来的imgproc.lib。

(If you input "make all",the problem is the same again.But if you delete all the file in build(rm -rf ./build/*) before "make all"(I use make clean ),you will success.I just success)

5)编辑/usr/local/cuda/include/host_config.h(不知道有没有用,这一步我看到有帖子改了,但大多数没改这个)

将其中的第115行注释掉:

#error-- unsupported GNU version! gcc versions later than 4.9 are not supported!

改为

//#error-- unsupported GNU version! gcc versions later than 4.9 are not supported!

(6)编译

make all –j8
make test –j8
make runtest –j8

7.编译pycaffe

在caffe根目录的python文件夹下,有一个requirements.txt的清单文件,上面列出了需要的依赖库,按照这个清单安装就可以了。

在安装scipy库的时候,需要fortran编译器(gfortran),如果没有这个编译器就会报错,因此,我们可以先安装一下。

首先回到caffe的根目录,然后执行安装代码:

1 cd ~/caffe
2 sudo apt-get install gfortran
3 cd ./python
4 for req in $(cat requirements.txt); do pip install $req; done

安装完成以后,再次回到caffe根目录我们可以执行:

1 cd ..
2 sudo pip install -r python/requirements.txt

就会看到,安装成功的,都会显示Requirement already satisfied, 没有安装成功的,会继续安装。

编译python接口:

 

make pycaffe  -j8

 

配置环境变量,以便python调用:

sudo gedit ~/.bashrc

export PYTHONPATH=/home/caffe/python:$PYTHONPATH添加到文件中

source ~/.bashrc
posted @ 2018-11-23 14:17  水木清扬  阅读(1144)  评论(0编辑  收藏  举报