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karyoploteR，是一个适用于所有基因组数据（any data on any genome）非圆环布局（non-circular layouts）的可视化 R/Bioconductor 包。开发该包的团队的目标是致力于打造一款能够像 Circo... 阅读全文
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2018 俄罗斯世界杯已经在 6月14日正式拉开了序幕，在这里小编为广大生信人奉上本次世界杯的赛程表（北京时间）。 希望大家在工作学习之余，能够开开心心去享受这场足球盛宴，同时祝福大家端午节快乐！ 32 强分组 小... 阅读全文
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全球亿万球迷翘首以盼的 2018 世界杯已经打响，在享受这份饕餮盛宴的同时，怎么向妹纸通俗易懂地解释 "越位" ？ 比如你和你的男朋友是一队 你的闺蜜是对方球队的守门员 当你传球给你的男朋友时 你的男票比对方任何人都更... 阅读全文
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曼哈顿图本质上是一个散点图，用于显示大量非零大范围波动数值，最早应用于全基因组关联分析(GWAS)研究展示高度相关位点。它得名源于样式与曼哈顿天际线相似(如下图）。 近几年，在宏基因组领域，尤其是差异OTU结合分类学结果，采用 Man... 阅读全文
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MobaXterm 又名 MobaXVT，是一款增强型终端、X 服务器和 Unix 命令集（GNU/ Cygwin）工具箱。 MobaXterm 可以开启多个终端视窗，以最新的 X 服务器为基础的 X.Org，可以轻松地来试用 Unix/L... 阅读全文
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在《UpSetR：多数据集绘图可视化处理利器》中我们介绍了 UpSetR 的一些概念和绘图基础参数使用，今天我们来学习一下 UpSetR 的 queries 和 attribute.plots 这两个高级参数的使用。 一 queries... 阅读全文
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说到集合数据可视化，我们第一时间想到的就是韦恩图。在 NGS 相关的研究中，韦恩图用来直观表征不同的集合之间元素重叠关系，是经常在文献中出现的图。 在集合数少的时候韦恩图是很好用的，但是当集合数多比如 5 个以上的时候那就会看的眼花缭乱了。... 阅读全文
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本文分享自微信公众号 - 生信科技爱好者（bioitee）。如有侵权，请联系 support@oschina.cn 删除。本文参与“OSC源创计划”，欢迎正在阅读的你也加入，一起分享。 阅读全文
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引言 Jupyter Notebook（原名 ipython）可是科学计算界的必备工具，友好的界面，方便的交互，支持 Markdown，集中的极客们想要的一切特点，同时又制作的如此优雅和精美，真是难能可贵的又好看又好用的工具。 官网 ... 阅读全文
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创建你的自定义 R 包 出于用户使用方便考虑，Anaconda 已经在 “R Essentials” 中打包了一些最常用的数据科学 R 包。使用 conda metapackage 命令创建您自己的 R 软件包以便与同行共享也非常容易。例如... 阅读全文