摘要: 一、背景 对于每个生物信息分析的人来说,ID 匹配(映射)是一项非常常见,但又很繁琐的任务。假设,我们有一个来自上游分析的 gene symbol 或报告的 ID 列表,然后我们的下一个分析却需要使用基因 ID(例如 Entrez gene id... 阅读全文
posted @ 2019-03-29 11:31 章鱼猫先生 阅读(200) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 我现在使用 Anaconda 作为我的主要 Python 发行版,同样,我们公司也将它用于所有开发人员机器以及他们的服务器。然而,前几天我在浏览一些论坛技术文章时遇到了一个我以前从未知道的 conda 精彩功能——conda 版本回滚!在这里给大家分... 阅读全文
posted @ 2019-03-09 17:25 章鱼猫先生 阅读(838) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: Bioconductor 是一个基于 R 语言的生物信息软件包,主要用于生物数据的注释、分析、统计、以及可视化(http://www.bioconductor.org)。 总所周知,Bioconductor 是和 R 版本绑定的,这是为了确保用户... 阅读全文
posted @ 2019-01-21 21:29 章鱼猫先生 阅读(2461) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 现在用人单位招人越来越难,而刚毕业的学生找工作也越来越难,为什么?这得归罪于国内大学的教育,并不是把人培养好,而是应试教育:填鸭的方式让大家反感,结果就是考完就忘。工作很多时候需要基础,基础的学习是很枯燥的,需要兴趣的滋润才能免强为之。所以,兴... 阅读全文
posted @ 2018-12-27 17:55 章鱼猫先生 阅读(32) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 由于微信不允许外部链接,你需要点击文章尾部左下角的 "阅读原文",才能访问文中链接。 通常,我们在使用大型数据集时,只会对其中的一小部分感兴趣,用以进行特定分析。 那么,我们应该如何对所有无关的变量和观察值进行排序并仅提取我们需要的那部分数据? ... 阅读全文
posted @ 2018-12-23 13:14 章鱼猫先生 阅读(140) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 由于微信不允许外部链接,你需要点击文章尾部左下角的 "阅读原文",才能访问文中链接。 这篇文章将介绍 10 个不同的 Linux 命令及其 R 实现方法。 如果您有兴趣学习更多 R 函数来处理文件的方法,请参考《R: HOW TO CREATE,... 阅读全文
posted @ 2018-12-16 17:44 章鱼猫先生 阅读(93) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 由于微信不允许外部链接,你需要点击文章尾部左下角的 "阅读原文",才能访问文中链接。 使用 Anaconda 3(conda 4.5.11)的 tkinter python 包(conda install -c conda-forge tk)开发... 阅读全文
posted @ 2018-12-02 19:37 章鱼猫先生 阅读(73) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Blast2GO 是一个基于序列相似性搜索的 GO 注释和功能分析工具,它可以直接统计分析基因功能信息,并可视化 GO 有向非循环图(DAG)上的相关功能特征,分析 BLAST、GO-mapping、GO 注释分析和富集分析结果。 Blast2G... 阅读全文
posted @ 2018-11-25 13:03 章鱼猫先生 阅读(47) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 由于微信不允许外部链接,你需要点击文章尾部左下角的 "阅读原文",才能访问文中链接。 今天在 CentOS 7.4 使用源码编译安装 Python-2.7.15 的时候,发现了一个非常奇怪的问题: $ ./configure --prefix... 阅读全文
posted @ 2018-11-17 18:30 章鱼猫先生 阅读(270) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Google Code Prettify 是 Google 的一款代码高亮插件,它由 js 代码和 css 代码构成,用来高亮显示 HTML 页面中的源代码。 Google Code Prettify 支持的语言数量比较多、比较全,支持自动识别代... 阅读全文
posted @ 2018-11-11 18:33 章鱼猫先生 阅读(149) 评论(0) 推荐(0) 编辑