R 语言常用操作与函数汇总
总结了一下 R 语言中常用的一些操作与函数使用，抛砖引玉，分享一下给大家，如有错误的地方欢迎留言指正。
怎样显示 R 软件中某个包中包含的全部数据集？
> library(MASS)
> data()
> data(package="MASS")
查看包加载的路径
system.file(package = 'ggplot2')
find.package("ggplot2")
查看包的安装目录
.libPaths()查看该包里面所有的函数
ls('package:ggplot2')查看已经安装的包目录
library()载入mypackage 包
library(mypackage)查看启动 R 时自动载入的包
getOption("defaultPackages")查看 'mypackage' 的帮助信息
help(package = 'mypackage')查看函数的参数
args(function)自动运行该函数帮助文档中的例子
example(function)展示一些包中 demostration
demo("package")有的包，特别是 bioconductor 的包有 vignette，用函数查看
vignette('mypackage')查看 vignette
openVignette('mypackage')
搜索 R 网站上的 "helpinfor" 相关信息
RSiteSearch("helpinfor")查看已经安装包的详细 HTML 文档
help.start()查看当前载入的包
search()查看 R 中载入的包
sessionInfo()查看 S4 类的方法
showMethods(class = "myClass")查看 method 的代码
findMethods("myMethods")查看某个对象的类：
class(myObject)查看某个 class 或者包的具体内容
getClass("class/package")查看某个 class 的 slot
getSlots("class")查看某个对象的 slot
slotNames(MyObject)卸除已加载的包
> detach("package:RMySQL")
# 注意是卸除，不是卸载，也就是说不是把包从 R 运行环境中彻底删除，只是不希望该包被加载使用。
# 该命令在包使用函数冲突，检验函数依赖时比较有用。
查看已安装的包
> installed.packages()[,c('Package','Version','LibPath')]
> installed.packages()["ggplot2",c('Package','Version','LibPath')]
# 其中 c('Package','Version','LibPath') 表示显示包名、版本、库路径信息，若无[,c('Package','Version','LibPath')]参数，则显示所有信息。
本文分享自微信公众号 - 生信科技爱好者（bioitee）。
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