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2018年6月15日
Trinotate-转录组注释
摘要: http://trinotate.github.io/ 装软件: Trinotate TransDecoder sqlite BLAST+ HMMER
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posted @ 2018-06-15 16:45 冰冻三丈
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Trinity-差异表达分析-无参
摘要: (已装RSEM、bowtie2) $ /util/align_and_estimate_abundance.pl --transcripts trinity.fasta --seqType fq --left 1.fq --right 2.fq --est_method RSEM --aln_met
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posted @ 2018-06-15 15:21 冰冻三丈
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RSEM-Ebseq-差异表达分析-无参
摘要: 1. RSEM的安装和使用: $ tar -xzf RSEM-1.3.0.tar.gz $ cd RSEM-1.3.0 $ make $ make ebseq $ echo 'PATH=$PATH:/.../' >> ~/.bashrc $ source ~/.bashrc $ extract-tr
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posted @ 2018-06-15 09:59 冰冻三丈
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