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2018年3月14日
BWA-Samtools-Bcftools SNP calling
摘要: SNP鉴定的标准流程有三个步骤: 一、mapping 使用BWA MEM将每个样本的测序数据比对到组装的参考序列。建立索引和比对: $ bwa index ref.fa $ bwa mem –t 40 ref.fa read1.fq read2.fq >aln-pe.sam 二、转换 $ samto
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posted @ 2018-03-14 17:42 冰冻三丈
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BWA: Burrows-Wheeler Alignment Tool比对
摘要: BWA
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posted @ 2018-03-14 10:54 冰冻三丈
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