Python实现DPABI当中“DICOM Sorted”功能
1. 前言
在对DICOM数据预处理之前很重要的一步是将扫描得到的文件按照不同的扫描序列区分开来。DPABI和PANDA工具包中已经提供了相应的功能模块。但由于是集成的模块,不容易及逆行扩展和调整。这里我们使用Python来实现DPABI当中的“DICOM Sorted”模块的功能。
2. 方法
这里主要使用pydicom包来读取DICOM文件的头文件。pydicom提供了两种访问数据头信息的方式,通过元素名称和标签号来访问。
DICOM Sorted会读取头文件中的序列号和序列描述这两个字段的信息。查看数据头信息发现这两部分的信息标签号和标签名分别为(0020, 0011, Series Number)和(0008, 103E, Series Description)。如下图所示。
import pydicom
ds = pydicom.dcmread(filename)
# by name
ds.SeriesNumber
# by DICOM tag number
ds[0x0020, 0x0011].value