摘要：
1. GLPK缺失 igraph::cluster_optimal社团检测算法依赖系统中的GLPK包。 MacOS 11.2 brew install glpk CentOS 7 wget http://download-ib01.fedoraproject.org/pub/epel/7/x86_6 阅读全文
摘要：
摘要 近些年，一些研究表明，机器学习和深度学习方法可以非常准确地预测大脑年龄。在本研究中，研究者提出了一种使用1016例（年龄范围为7-64岁）T1加权像的，基于复杂网络的方法来预测大脑年龄的模型。研究者介绍了一种人脑的结构连接模型：将T1像分割成一系列的立方体块作为网络的节点，然后计算立方体块之间 阅读全文
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前言 本文用于记录笔者在将R语言中的for语句并行化处理中的一些问题。 实验 这里使用foreach和doParallel包提供的函数实现for语句的并行处理。 for语句脚本 func <- function(x, y, z) { return(x^y/z) } # >>> main <<< x 阅读全文
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一个MRI影像数据可以简化为一个多维数组加上元数据构成的集合。其中，元数据通常为影像数据的头信息。以结构影像为例，它由一个三维数组data和相应的元数据构成。 以下内容参考自1。 体素坐标 我们可以通过数组的下标来获取数组中任意位置元素的数值。这些下标即位数据的体素坐标。对于结构数据而言，它的体素坐 阅读全文
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先前记录了使用R语言生成特定颜色的colorbar，具体链接为：https://www.cnblogs.com/sangf/p/13689854.html 。但当时生成的colorbar放大的时候，会发现颜色不是连续的。它其实是很多的矩形块。两个块之间会有很细微的断层。这里使用Python来实现同样 阅读全文
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直方图可以大致查看数据分布是否为正态。通常还需要将正态分布的曲线叠加在上面。 导入需要的包 import numpy as np from scipy import stats import matplotlib.pyplot as plt 定义生成均值为mu，方差为sigma的正态分布对应y值的函 阅读全文
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线性坐标在显示有较大区值范围的$x$和$y$时（$x$和$y$的取值范围有很大尺度的差异）不能很清楚地将两者的对应关系表现出来。对于函数$y=log_{10}x, x\in[1, 100000]$在线性坐标下如图一所示。 import matplotlib.pyplot as plt import 阅读全文
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ER随机网络全称为埃尔德什（Paul Erdos）-雷尼(Alfred Renyi)随机网络。生成该网络的算法描述如下： 从N个孤立节点开始； 选择一对节点，产生一个0-1之间的随机数。如果该随机数小于p，则这对节点之间放一条连接；否则，该节点对保持不连接； 对所有N(N-1)/2个节点对重复步骤2 阅读全文
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Advanced Normalization Tools (ANTs) 可以用来对结构和功能影像进行预处理。以下是通过源码编译安装的步骤。 首先安装git，cmake和g++。然后按照以下步骤进行安装即可： 1. git clone git://github.com/stnava/ANTs.git 阅读全文
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1. 前言 python读取nifti文件需要nibabel这个包，所以在第一次使用的时候需要安装它。命令是pip install nibabel. 2. 方法 2.1 读取 import nibabel as nib nii = nib.load('data.nii') data = nii.ge 阅读全文