Eigen相关介绍
最近在用Matlab处理图像，现在要做的是将其用C++语言进行翻译，由于要进行大量的矩阵计算，就研究了一下可以进行矩阵计算的开源库，详细的介绍可以参照http://my.oschina.net/cvnote/blog/165340，我从中选择了Eigen进行了一番学习，现在对里面一些基础知识做一下小结。以下内容可以看做它官方在线文档的一个学习笔记，粗略看看还是感觉很强大的，而且由于只包含头文件，方便跨平台使用，打算去使用一下。详细内容可以参照官方文档：http://eigen.tuxfamily.org/index.php?title=Main_Page 。
Dense matrix and array manipulation
The Matrix class
创建语法：Matrix<typename Scalar, int RowsAtCompileTime, int ColsAtCompileTime， int Options, int MaxRowsAtCompileTime, int MaxColsAtCompileTime >， 其中Scalar是矩阵类型，有int、float、double、complex float、complex double等。
RowsAtCompileTime和ColsAtCompileTime是编译时创建数组的大小。Eigen还定义了许多convenience typedefs 比如
Typedef Matrix<float, 4, 4> Matrix4f;
Options可以定义一些矩阵的属性，不如存储顺序是按列存储还是按行存储；
MaxRowsAtCompileTime 和MaxColsAtCompileTime 是规定矩阵的最大范围，以防动态分配（下面介绍）时分配过大。
向量是一种特殊的矩阵，也有很多convenience typedef，如
Typedef Matrix<float, 3, 1> Vector3f;
这种定义方式得到的是列向量，数据是按列存储，还可以定义行向量：
Typedef Matrix<int, 1, 2> RowVector2i;
矩阵大小也可以不在编译时设置，而是动态设定，如
Matrix(double, Dynamic, Dynamic)
向量也是如此：
Matrix(int, Dynamic, 1)
定义时可以对其进行初始化：
MatrixXf a(10, 15); //定义了一个10*15的矩阵
Vector2d a(5.0, 6.0);
矩阵变量允许下标访问，不过是采用括号，例如定义一个变量
Matri3dx m = Matrix3d::Random(); //生成一个3*3的随机矩阵。
访问第二行第三个元素，可以使用m(1, 2)来进行访问。
rows(), cols(), size()函数可以用以返回矩阵的行数、列数和元素个数。
Resize()函数可以用来改变矩阵或者向量的大小，但对于行数和列数固定的矩阵或向量进行修改会导致错误产生。
对于编译时未规定数组，如果在定义时两个矩阵长度不同，也可以进行赋值操作，只不过会将被复制的矩阵size改变，如
MatrixXf a(2, 2); MatrixXf b(3, 3);
b = a;
则此时b是一个2*2的矩阵。
需要说明的是，如果声明一个矩阵用固定大小的方式(e.g. Matrix4f)，效率比用动态动态声明(MatrixXf a(4, 4))高很多。
Matrix and Vector Arithmetic
定义了矩阵相加、相减、相乘等操作
需要注意的是，在做矩阵计算是，用的是循环语句，所以是串行计算的方式。
Eigen还提供了一些常用的变换函数：transpose()，转置操作：conjugata()，共轭操作；adjoint()，共轭转置操作；需要注意的是这些是非原位操作，例如a = [1, 2;, 3, 4] 那么a = a.transpose() 得到的a为[1, 2, 2, 4]，这样就产生了所粗。原位转置操作可以使用transposeInPlace() 函数。
矩阵乘法是一个特殊的运算，为了防止上述的错误，矩阵与矩阵相乘都会使用临时变量，例如m = m* m; 在实际编译的时候是tem = m* m; m = tem; 如果在乘法中你可以确定不会有错误的产生，那么可以使用noaliasd()函数来避免产生临时变量，例如：c.noalias() += a * b;
Eigen还提供了dot()点乘函数和cross()叉乘函数。其中dot可以针对任意两个长度相等的向量，而叉乘只能是两个三维向量，例如Vector3d v(1, 2, 3); Vector3d w(0, 1, 2); 那么v.dot(w) 得到的结果是8（等价于v.adjoint() * w），v.corss(w)得到的结果是(1;-2;1)。
Eigen提供了一些基础的算法，如sum()，求所有元素和；prod()，求所有元素之积；mean()，求元素平均值；minCoeff()，最小元素；maxCoeff()，最大元素；trace()，求迹等。下面给出一个实例：
上述例子不仅求出了最小值，也求得了最小值所在的位置，类似于Matlab中find的用法。
The Array class and coefficient-wise operations
Array也是一个模板类，可以跟Matrix进行对比，声明一个Array对象的方式与Matrix相似：
Array<typename Scalar, int RowsAtCompileTime, int ColsAtCompileTime>
参数与Matrix一致，这里不多做介绍，详细可看官方文档。Array也定义了许多conventional typedef，如
Array的赋值、加法、减法也与Matrix类似，需要说明的是Array相乘，这个操作类似于Matlab中的".*"，对应元素做计算，所以两个Array相乘，只能是大小相同的Array。
Array提供了一些操作函数，abs()，求每个元素的绝对值；sqrt()，求每个元素的算术平方根；a.min(b)，求a和b中每个位置较小的元素。
Matrix和Array可以进行互换，利用matrix中的Array()函数和Array中的Matrix()函数，下面给出实例
需要说明的是，将array表达式赋值给Matrix变量是允许的；cwiseProduct()函数允许Matrix直接进行点对点乘法，而不用转换至Array。
Block Operations
利用block()函数，可以从Matrix中取出一个小矩阵来进行处理，使用的语法为matrix.block(i, j, p, q); 和 matrix.block<p, q>(i, j)。其中i，j是block左上角元素位于矩阵中的位置，p、q是block的大小，如果是小块的话，那么采用第二种方法，在编译时就固定p、q，速度会比第一种方法快一些。
需要特别注意的是，block利用非常灵活，原因在于它不仅仅可以是右值表达式，它也可以作为左值对matrix进行修改。同样Array也有block函数，如下面实例
Block函数可以从矩阵中提取一块，特殊的如提取一整行或者一整列，如想达到如此操作，可以使用row()函数和col()函数，已达到更高效率。这两个函数很类似与Matlab中":"操作符。
如果想在矩阵中操作角落的block，Eigen还提供了一些特殊的函数：
最后一列如果在操作大小固定的小block时，在编译时提供size，可以达到更快的效果。同样对于vector，也有类似的操作函数：
Advanced Initialization
简单初始一个矩阵的方法是利用逗号表达式，初始顺序是从左到右、从上到下。可以一个元素一个元素的初始矩阵，也可以一次用一个矩阵去初始大矩阵的一部分，如
同样利用上面讲的block去初始矩阵的一部分：
Eigen提供了一些函数来初始特殊的矩阵，如Zero()用以初始全领的矩阵，其size可以通过参数或者命名空间设置，如Array33f::Zero(), ArrayXf::Zero(3), ArrayXXf::Zero(3, 4)；Constant(rows, cols, value)，用以初始元素相等的矩阵；Random()，用以初始一个随机矩阵；Identity()，用以初始一个单位阵，但这个函数只针对Matrix类型，不针对Array类型。LinSpaced(size, low, high)是一个特殊的函数，功能类似Matlab中的冒号用法，如下面实例：
Eigen也提供了一个函数来进行初始设置，如setZero(), MatrixBase::setIdentity(), DenseBase::setLinSpaced()等，如我们要生成一个矩阵$\begin{bmatrix} 0 & I \\ I & 0 \end{bmatrix}$，可以有下面几种方法：
上面介绍的例子中，一些方法如Zero(), Constant()等用以初始一个矩阵，我们可以认为这都是生成一个临时矩阵用以初始化，但事实是他们返回了一个所谓expression objects，而这不会引起多余的开销。例如我们想令一个$2 \times 3$的矩阵行互换，即左乘一个$$\begin{bmatrix} 0 & 1 \\ 1 & 0 \end{bmatrix}$$。
上述的finished()是必要的，因为要获取一个实际的matrix来进行乘法计算，而不是一个用于初始某个矩阵的临时矩阵，它表明要在这个矩阵形成之后在用以做乘法计算。
Reductions，Visitors and Broadcasting
Reductions可以看做一个作用在matrix或者vector上的函数，返回结果是一个值，比如之前介绍的sum(), prod(), trace(), minCoeff()等，这里再介绍一类Reductions—Norm computations。Eigen提供了范数类函数，norm()，如$l_2$范数，squaredNorm(), $l_p$范数，lpNnorm<p>(),这里的p可以是1或者无穷。
Reductions还有一类波尔类型，即一个矩阵可以对其中每一个元素进行大小比较。all()，如果每个元素都为真，则为真；any()，如果有一个元素为真，返回真；count()，为真元素的个数，如下面的例子所述：
在使用maxCoeff()和minCoeff()函数是，可以寻求最大元素和最小元素，但如果我们想返回其位置，则需要给定相关参数，而参数的类型我们要使用Index类型，例如：
Reductions还可以部分使用，即返回的不是一个值，而是一组值，可以看做是一种降维操作，所使用的函数为colwise(), rowwise()。例如
Mat.colwise()理解为分别去看矩阵的每一列，然后再作用maxCoeff()函数，即求每一列的最大值。
需要注意的是，colwise返回的是一个行向量（列方向降维），rowwise返回的是一个列向量（行方向降维）。
下面说一下Broadcasting，他与Reductions的部分使用类似，但是他作用的类型是vector，相当于把vector按照某种方式进行扩充，再与矩阵进行计算。如
Mat.colwise() += v;是核心语句，相当于$\begin{bmatrix}1 & 2 & 6 & 9\\ 3 & 1 & 7 & 2\end{bmatrix} + \begin{bmatrix}0 & 0 & 0 & 0\\ 1 & 1 & 1 & 1\end{bmatrix}$
经过上面介绍，我们来一个实例：
m.colwise() – v得到的是 $\begin{bmatrix}-1 & 21 & 4 & 7\\ 0 & 8 & 4 & -1\end{bmatrix}$，再将得到的矩阵取列，再求$l_2$范数的平方，即(m.colwise()-v).colwise().squaredNorm()得到的是$\begin{bmatrix}1 & 505 & 32 & 50\end{bmatrix}$，最后再求这一列的最小值，并记录位置。输出时m.col(index)便将最小的那一列输出。
Interfacing with Raw Buffers: the Map class
Map类型，给用户一种选择：在已经存在的矩阵或者向量中，不必拷贝对象，而是直接在该对象的内存上进行操作。创建语句如下：
Map<Matrix<typename Scalar, int RowsAtCompileTime, int ColsAtCompileTime>>；
由此可见Map需要一个模板参数，还要确保给予一个指向该类型的指针，如
Map<MatrixXf> mf(pf, rows, cols)；
其中pf是有一个float指针。
Map还可以接受两个参量，即Map<typename MatrixType, int MapOptions, tyepname StrideType>，MapOptions可以有Aligned和Unaligned两个选择；StrideType是对如何具体选择数据的一个选择，看下面两个实例
上面实例解释了在创建Map的时候，如何决定内存的存储顺序；下面的实例将重点解释StrideType
class Eigen::Stride< _OuterStrideAtCompileTime, _InnerStrideAtCompileTime >，这是stride的声明语法，有两个int类型的参数：OuterStride是按行存储矩阵每行之间的增量或者按列存储矩阵每列之间的增量，InnerStreide是按行存储矩阵每列之间的增量或者按列存储矩阵每行之间的增量。具体增量可以编译时给定，也可以运行时给定，即设置为Dynamic。上面的例子中，MatrixXi是按列存储，运行时stride的第一个参数是8，即每列之间相差8个位置；第二个参数是2，即每行直接相差2个位置；所以该矩阵存储为
$$\begin{bmatrix}array[0] & array[8] & array[16]\\ array[2] & array[10] & array[18]\\ array[4] & array[12] & array[20]\end{bmatrix}$$
下面给一个使用Map变量的实例
需要注意的是，这里m2，m2map和m2mapconst指向的是同一块内存。
同样，Map也可以改变指向的内存，利用New语句，方法如下：
这里v改变的只是指向内存的位置，并没有为此新开辟内存，而且在声明v的时候，应该已经有存在的内存区域被指向，即不会使用如下语句：
Map<Matrix3f> A(NULL);
Aliasing
混淆往往出现在赋值号左右都用同一变量的时候，如mat = mat.transpose();解决方法之一是使用eval()函数，看下面两个实例
如果有xxxInplace()函数，用这个函数可达到最高效的效果，如transposeInPlace()
通常情况下，如果元素的表达只与该元素自己有关，那么一般不会引起混淆，如语句：mat = (2 * mat – MatrixXf::Identity(2, 2)).array().square();
矩阵乘法是个特殊的操作，编译器会默认为其做避免混淆的处理，尽管这会引起额外的开销。如果你确定不会引起混淆，可以使用noalias()函数来避免额外开销。
总结一下：
- 对于单个元素操作，如单个元素成绩或者加减操作一般不会引起混淆。
- 两个矩阵相乘时会做避免混淆的处理，如果你能确定不产生混淆，可以使用noalias()函数来避免额外开销。
- 其他情况下，都认为没有混淆存在，为了避免混淆产生，使用eval()函数或者xxxInPlace()函数，后者效率更高。
Storage orders
Matrix 创建的矩阵默认是按列存储，如果想修改可以在创建矩阵的时候加入参数，如Matrix<int, 3, 4, ColMajor> Acolmajor; 或者 Matrix<int, 3, 4, RowMajor> Arowmajor;
在选择存储顺序的时候，要有如下考虑：
- 你的使用者希望你用哪种方式存储，这可能跟其他处理库所要求的存储顺序有关。
- 与你所处理的实际算法有关。
- Eigen库在处理按列存储的矩阵时会更加高效。
