02 2023 档案
摘要:# 如果没有安装paramiko,用pip install paramiko安装import paramiko, os, timedef update(addr, usr, pasw, fn, target_path): trans = paramiko.Transport((addr, 22))
阅读全文
摘要:深度(depth): 总测序reads数 / 目标区域长度 覆盖度(coverage): 至少有一个碱基覆盖的位置数量 / 目标区域长度
阅读全文
摘要:ls是最常用的unix命令之一,用于展示目录下的文件 参数及意义 参数名 含义 a 显示隐藏文件 l 成列显示更多信息 v 按数字排序 h 将文件大小用单位表示。如1.2G 示例: ls -lh
阅读全文
摘要:pip安装时警告:the ssl module in Python is not available Python版本为3.11.1。 问题是缺少ssl包(或者是证书方面的问题),把源设置成http再加上信任该网址的参数就行了: # 永久换源pip config set global.index-u
阅读全文
摘要:如何退出 Esc + :q(或者:wq,如果你改了东西要保存的话;:!q不保存,强制退出) 讲个笑话:我用vim三年了,因为我到现在都不知道怎么退出! 删除所有内容 Esc + ggdG 跳转到指定行 Esc + :行号 进入编辑模式 按i或者insert键等 搜索关键字 :/ 或者 # 去除背景色
阅读全文
摘要:通过两个文件查看: CPU /proc/cpuinfo 内存 /proc/meminfo 例: cat /proc/meminfo
阅读全文
摘要:单端: bowtie2 -U 文件名 -p 进程数 1>结果保存位置 双端(两个文件): bowtie2 -1 双端文件1 -2 双端文件2 1>结果保存位置 双端(单个文件): bowtie2 --interleave 文件名 -p 进程数 1>结果保存位置 常用参数含义: 参数名 含义 --no
阅读全文
摘要:中断程序 命令行输入: kill -2 pid(进程id)(等同于ctrl + C) 键盘快捷键:ctrl + C 终止程序 命令行输入: kill -3 pid(等同于ctrl + |,但某些程序可能不支持) #或者 kill -9 pid(终止信号) # 或者 kill pid(同-9) 键盘快
阅读全文