机器学习:异常检测算法Seasonal Hybrid ESD及R语言实现
Twritters的异常检测算法(Anomaly Detection)做的比较好,Seasonal Hybrid ESD算法是先用STL把序列分解,考察残差项。假定这一项符合正态分布,然后就可以用Generalized ESD提取离群点。
目标是检测出时间序列数据集的异常点,如图所示,蓝色线是时间序列数据集,红色是圈是异常点。
R语言实现如下,一些依赖包需要install.packages("")或者手动在cran社区下载(注意依赖包的下载)。本人github下载源码。
1 主函数是,包含了主要逻辑,加载数据集,IMSHESD算法检测异常点和画出数据集和异常点。IMSHESD算法是主要功能,下面详细介绍。
library(zoo) path_data="E:/Develop/Rstudio/IMS-H-ESDS/3151.csv" path_sear="E:/Develop/Rstudio/IMS-H-ESDS/IS-H-ESD.R" source(path_sear) data <-read.table(path_data,sep=",",skip=1) print(data) test_data=IMSHESD(data) plot(x=data[[1]], y=data[[2]],xlab="time",ylab="value",col="blue",type="l") lines(x=test_data[[1]], y=test_data[[2]],col="red",type="p")
2 IMSHESD算法是主要逻辑如下,通过Fourier转换自动求得时间序列的季节周期peri(必须满足数据集的长度>2*peri+1才可以应用时间序列分析),按照季节周期对数据集做划分,然后应用anmodetection异常检测算法探测异常。
IMSHESD<-function(data,group_peri=60) { path_Fourier="E:/Develop/Rstudio/IMS-H-ESDS/Fourier.R" path_data_group="E:/Develop/Rstudio/IMS-H-ESDS/data_group.R" path_anmo_detection="E:/Develop/Rstudio/IMS-H-ESDS/anmo_detection.R" source(path_Fourier) source(path_data_group) source(path_anmo_detection) #data <-data_group(data,mode="median",group_period=60) peri=Fourier_trans(data) print(peri) if(ncol(data)!=2) { print("The col of data must be two!") stop() } if((2*peri+1)<length(data[[2]])){ data_sep_length=ceiling(2*peri+1) print(data_sep_length) all_data <- vector(mode="list", length=ceiling(length(data[[1]])/(data_sep_length))) for(j in seq(1,length(data[[1]]), by=data_sep_length)){ start_data <- data[[1]][j] end_data <- data[[1]][min(j + data_sep_length, length(data[[1]]))] if(j+data_sep_length<length(data[[1]])){ all_data[[ceiling(j/(data_sep_length))]] <- subset(data, data[[1]] >= start_data & data[[1]] < end_data) }else{ all_data[[ceiling(j/(data_sep_length))]] <- subset(data,data[[1]] >= data[[1]][length(data[[1]])-data_sep_length] & data[[1]] < end_data) } } res=c() for(i in 1:length(all_data)) { res_temp=anmodetection(all_data[[i]],anoms_per=0.1,period=peri,alpha=0.05) res=c(res,res_temp) } data_plot=rep(c(0),length(res)) for(i in 1:length(res)) { data_plot[i]=data[[2]][which(data[[1]]==res[i])] } anmo_point<-data.frame(res,data_plot) }else{ print("This is not a seasonal time series") stop() } }
3 Fourier转换自动求得时间序列的季节周期peri。
Fourier_trans<-function(data) { install.packages("TSA") library(TSA) p=periodogram(data[2]) dd=data.frame(freq=p$freq,spec=p$spec) order=dd[order(-dd$spec),] top2=head(order,3) time=min(1.00/top2$f) }
4 异常检测主要逻辑anmodetection函数,需要规定异常点的上限10%,STL分解数据集:周期+趋势+随机噪声=原始时间序列(分解方法有Twitters的Decompose和STL),残差项根据正态分布(方差未知使用学生t分布),提取离散点。假设要检测k个离群点,就对数据重复使用k次ESD检验,如果发现离群点就从数据里剔出去,然后在剩下的数据上重新检测(Generalized ESD)。
anmodetection<-function(data,anoms_per=0.10,period=7,alpha=0.05,mode="addi") { num <- length(data[[2]]) #cat("num",num) num_anmo=trunc(anoms_per*length(data[[2]])) R_idx=rep(seq(0),length(data[[2]])) if(ncol(data)!=2) { print("The col of data must be two!") stop() } data_decompose <- stl(ts(data[[2L]], frequency =period),"periodic",robust = TRUE) seasonal_data <- data_decompose$time.series[,1] #cat("seasonal_data",seasonal_data) trend_data <- data_decompose$time.series[,2] random_decomp <- data_decompose$time.series[,3] data<-data.frame(times=data[[1]],count=(data[[2]]-seasonal_data-median(data[[2]]))) func_med <- match.fun(median) func_mad <- match.fun(mad) numb_anom=0 for(n in 1:num_anmo) { data_norm<-abs(data[[2]]-func_med(data[[2]])) data_mad<-func_mad(data[[2]]) data_res<-data_norm/data_mad R_res<-max(data_res) max_temp_idx <- which(data_res == R_res)[1] R_idx_out=data[[1]][max_temp_idx] R_idx[n] <- R_idx_out data <- data[-which(data[[1]] == R_idx[n]), ] p <- 1 - alpha/(2*(num-n+1)) t <- qt(p,(num-n-1)) thres <- t*(num-n) / sqrt((num-n-1+t**2)*(num-n+1)) if(R_res>thres) { numb_anom <- n } } if(numb_anom>0) { R_idx <- R_idx[1:numb_anom] } else { R_idx = NULL } return(R_idx) }
实验结果:红色圈标出了异常点,异常点是10%的比例。
参考
Twitters异常检测方法,https://anomaly.io/blog/