摘要: 恢复内容开始 GATK4流程 准备配套数据 明确参考基因组版本!!!b36/b37/hg18/hg19/hg38,记住b37和hg19并不是完全一样的,有些微差别。 1、下载参考基因组 下载地址很多,常用的就是NCBI,ensembl和UCSC,这里推荐用这个脚本下载(下载源为UCSC): 1 # 阅读全文
posted @ 2022-01-27 16:02 Riven_zrw 阅读(346) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: echo打印制表符到文件: MAP_PATH=/path/for i in `cat sp.list`; do echo -e "${MAP_PATH}/${i}.${i}/${i}.final.bam\t250\t${i}" >> config; done 阅读全文
posted @ 2020-05-26 18:26 Riven_zrw 阅读(23) 评论(0) 推荐(0) 编辑