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摘要: 转载:http://blog.sina.com.cn/s/blog_670445240101nidy.html 网址:http://cd-hit.org ;http://www.bioinformatics.org/cd-hit/ ; 下载:http://www.bioinformatics.org 阅读全文
posted @ 2017-08-23 16:10 风中之铃 阅读(3624) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 转载:http://blog.sina.com.cn/s/blog_5ecfd9d90100ksui.html http://www.docin.com/p-704735699.html 与之前的blast相比,新的blast+将blastn,blastx等合作与blastall命令分隔开来,对各个 阅读全文
posted @ 2017-08-23 14:37 风中之铃 阅读(6115) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 转载:http://www.cnblogs.com/xudongliang/p/7283733.html data <- data.frame(mean = c(10, 15), sd = c(12, 17))rownames(data) <- c("case", "control") par(lw 阅读全文
posted @ 2017-08-20 14:08 风中之铃 阅读(1900) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 转载:庐州月光 http://www.cnblogs.com/xudongliang/p/6907733.html 三代测序下机的原始数据不再是fastq格式了,而是换成了hdf5 格式,在做三代数据的分析之前,有必要先搞清楚hdf5 这种文件格式; 转载:庐州月光 http://www.cnblo 阅读全文
posted @ 2017-08-20 14:05 风中之铃 阅读(534) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 转录本(transcript)长度范围 3214482 到3671498 3214482--3216021 3216022--3216024 3216025--3216968 3421702--3421901 3670552--3671348 3671346--3671348 3671349--36 阅读全文
posted @ 2017-08-20 13:15 风中之铃 阅读(2249) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 参考博客:http://www.cnblogs.com/xudongliang/tag/perl/ 1、perl 模块的创建以及制定perl 模块的路径 (1)创建一个Myfun.pm模块。 #/usr/bin/perl package Myfun; use warnings; use strict 阅读全文
posted @ 2017-08-19 21:59 风中之铃 阅读(1107) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 转载:http://www.cnblogs.com/xudongliang/p/6497465.html 嵌合体序列:由来自两条或者多条模板链的序列组成,示意图如下: 在PCR反应中,在延伸阶段,由于不完全延伸,就会导致嵌合体序列的出现,以上图为例, 在扩增序列X的过程中,在序列延伸阶段,只产生了部 阅读全文
posted @ 2017-08-19 18:19 风中之铃 阅读(468) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: http://note.youdao.com/share/?id=312fa04209cb87f7674de9a9544f329a&type=note#/ https://davetang.org/wiki/tiki-index.php?page=SAM 编辑距离Edit Distance:从字符串 阅读全文
posted @ 2017-08-19 17:52 风中之铃 阅读(1120) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: IDPASE https://github.com/bdeonovic/IDPASE.jl Prepare necessary input files (1)FASTQ file of your hybrid-Seq data ##cat fq1 fq2 cat fq1 fq2 >fq (2) PS 阅读全文
posted @ 2017-08-18 17:53 风中之铃 阅读(428) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: https://genome.ucsc.edu/FAQ/FAQformat.html#format9 1、Variant Call Format(VCF) Example 2、Gene Predictions (Extended)(GPD) The following definition is u 阅读全文
posted @ 2017-08-17 16:37 风中之铃 阅读(371) 评论(0) 推荐(0) 编辑
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