摘要:
投qsub任务程序挂起和恢复 Linux(转载:http://blog.sina.com.cn/s/blog_ea61e3630102w7vd.html) 投qsub任务程序挂起和恢复 Linux(转载:http://blog.sina.com.cn/s/blog_ea61e3630102w7vd. 阅读全文
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转载:https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI1MjU5MjMzNA==&mid=2247484731&idx=1&sn=b15fbee5910b36341bf366860ee5df53&scene=21#wechat_redirect 这次给大家带来的是ENCODE 阅读全文
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参考:https://www.sogou.com/link?url=DOb0bgH2eKh1ibpaMGjuy6YnbQPc3cuKbWqIy1k6SBFomuBEhdSpHkUUZED5fr2OTkh3_01_UomO4oOua-YE2A..1、将sam文件转换成bam文件 $ samtools 阅读全文
摘要:
核酸数据库:一级:NCBI NIH EMBL ENA DDBJ NIG (共同组成INSDC) ENsemble JCVI(宏基因组,HMP: Human Microbiome Project)等 二级:wormBase FlyBase Unigene等 蛋白数据库: 一级:蛋白序列数据库 Swis 阅读全文
摘要:
1、prefetch SRRxxxxxx ~/ncbi/public/sra 2、fastq-dump --split-files xxxxxxsra 3、SRA、SAM以及Fastq文件高速下载方法 3.1 NCBI-SRA和EBI-ENA数据库 SRA数据库: Sequence Read Arc 阅读全文
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参考:http://blog.csdn.net/Cs_mary/article/details/78378552 ###prefetch 参数解释 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK158900/#SRA_download.how_do_i_use_the_ 阅读全文
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(转):http://liyx985.iteye.com/blog/2386867 http://liyx985.iteye.com/blog/2386867 我一直没有搞得很清楚,回车和换行符有啥区别。记得大一时,C语言老师就说过回车、换行,但都没说得那么细。前两天,看写两句Perl代码时, 忽然 阅读全文
摘要:
参考文献:http://www.jianshu.com/p/a63595a41bed http://kaopubear.top/categories/ ####生物信息和编程 RNA-seq基本流程 下图是一个大概的RNA-seq基本流程 把RNA破碎成小片段,然后将RNA转变成一条cDNA,这一步 阅读全文