python c扩展

本文转至 http://blog.csdn.net/gitchat/article/details/78537098

 

目录

1   简介
    1.1   Python扩展模块的用途和优点
    1.2   设计扩展模块的流程
2   setup.py脚本
3   函数接口、参数传递、简单返回值
    3.1   函数接口
    3.2   参数传递
    3.3   简单返回值
4   元组、列表、字典、缓冲区
5   异常处理、引用计数
    5.1   抛出异常
    5.2   引用计数
6   GIL与多线程

1. 简介

本文记录Python的扩展模块开发中的常用惯例,以便读者可以低成本的使用Python扩展模块来提高应用性能。

文本不是扩展模块的入门教程,而是面向对扩展模块有一定概念,但一直未能有效应用起来的读者。

1.1   Python扩展模块的用途和优点

Python扩展模块的常见几种用途及其优点:

提升计算性能

Python的扩展模块使用C/C++编写,其计算性能也是C/C++同级别的。跨语言通信接口上的性能损失小到忽略不计,所以能够提供非常好的性能支持。典型如Numpy包,用于科学计算,其底层调用了第三方的数学计算库,性能也是同级别的。

使用多核心计算能力

扩展模块通过对GIL的控制,可以使用上CPU的多核心计算能力,而不是受限于纯Python程序的单核心限制。结合多线程可以定制使用多少个核心。

系统组件隔离和模块化

通过把每个C/C++函数提供给Python接口,使得函数之间不共享任何状态,实现了良好的组建隔离,有助于开发和测试。同时由于参数全部通过Python传递,易于打印和中断,可调试性有了很大的提高。

使用第三方库

并非每种库都有Python支持,此时就需要自己编写扩展模块实现系统对接了。但现代流行的大型库,很多都有官方的Python扩展模块,使得应用质量有了较大提高,典型如OpenCV和PyCUDA。

1.2 设计扩展模块的流程

  • 编写setup.py:配置扩展模块元信息的脚本

  • 引入必要头文件:以Python.h为主的几个常用头文件

  • 设计导出函数表:导出给Python使用的函数表

  • 模块初始化函数:几个必要的初始化步骤

2. setup.py脚本

setup.py脚本是用于构建扩展模块的配置。简单的网上有很多,而如下给出一个项目中比较实用的例子:

import platform
from distutils.core import setup,Extension
from distutils import sysconfig

cfg_vars=sysconfig.get_config_vars()
if 'OPT' in cfg_vars:
    cfg_vars['OPT']=cfg_vars['OPT'].replace('-Wstrict-prototypes','')

mod_expy=Extension('libxx.expy',
    sources=['libxx/expy.c',],
    libraries=['jpeg',],
    include_dirs=['/opt/local/include',],
    library_dirs=['/opt/local/lib',],
    define_macros=[('MAJOR_VERSION','1'),('MINOR_VERSION','0')],
    )

 #区分各种平台的编译
if platform.system()=='Darwin':
    os.environ['ARCHFLAGS']='-arch x86_64'
    extmodlist=[mod_expy,]
elif platform.system()='Linux':
    os.environ['ARCHFLAGS']='-arch i386 -arch x86_64'
    extmodlist=[mod_expy,]
else:
    raise RuntimeError('Unknown system()=%s'%repr(platform.system()))

setup(name='libxx',
    version='1.0',
    description='libxx-python',
    author='gashero',
    author_email='xxx@xxx.xxx',
    packages=['libxx',],
    ext_modules=extmodlist,
    url='http://example.com/',
    long_description='xxxxxx xxxxxx',
)

相对于各种Hello World级别的setup.py。如上脚本增添的实用性功能:

  • 提供了更完善的编译参数,比如编译时特定的宏定义,编译器参数等

  • 引用了其他第三方库

  • 区分不同平台的编译,对Linux和Mac有所区分

  • 提供欧冠你了更加完善的元信息

通常大家自己编写的扩展模块规模都不大,如上setup.py脚本也足够使用了。如果涉及到更复杂的多个源文件的扩展模块,只需要继续增加Extension对象即可。

3. 函数接口、参数传递、简单返回值

3.1   函数接口

用于定义函数,并传递给Python调用。就是定义PyMethodDef类型的实例。一个例子如下:

static PyMethodDef expyMethods[]={
    {"add",expy_add,METH_VARARGS,"Add 2 number"},
    {NULL,NULL,0,NULL}
};

此定义的4个字段中的第3个字段用以决定函数的调用方式,可选如下:

  • METH_VARARGS:多个形式参数,最常用的玩法

  • METH_NOARGS:无参数,常用于输出类函数

  • METH_VARARGS|METH_KEYWORDS :同时拥有匿名参数和关键字参数

最后一个字段则是函数的文档,用于 help() 函数时显示。

3.2   参数传递

使用匿名参数和包含关键字参数的函数定义是不同的,两者如下:

static PyObject* func(PyObject* self, PyObject* args);
static PyObject* func(PyObject* self, PyObject* args, PyObject **kwargs);

如果没有对应的内容则会传递来NULL。对于模块函数,而不是对象方法,可以不关注self。

参数解析过程使用 PyArg_ParseTuple() 和 PyArg_ParseTupleAndKeywords() 。用一个字符串来描述参数列表,随后传入各个对象的引用地址。

鉴于参数和返回值的类型可能不是对双方都友好,所以一般建议不要传递的类型:

  • 体系结构相关的数字类型,如int、long,而是传递长度已知的数字类型

  • 结构体,因为结构体实际存储的位置可能是有生命周期的,同样适用于C++的对象

  • 地址指针,因为也是体系结构相关的,包括函数指针

实际上需要传递地址、结构体、对象时,一般建议在扩展模块里写个对象,虽然更困难一些,但是兼容性会好的多。

不要把任何内容留在C/C++程序里,如全局变量。

3.3   简单返回值

函数的返回值必须是Python对象。

简单的没有返回值的函数,可以直接在函数末尾使用一个宏来实现:

Py_RETURN_NONE;

这对于简单那的输出函数是没问题的。

更复杂一点的可以使用 Py_BuildValue() 也是用一个字符串描述格式后传入各个值,甚至可以构造复杂的数据结构。

4.  元组、列表、字典、缓冲区

元组在Python中的作用是不可修改的,这对于返回内容给Python是很友好的,而且性能也比列表要好。

列表的价值在于可以存储长度不固定的内容。比如C/C++很多的第三方库会用迭代的方式返回内容。在函数开始时并不知道能返回多少个对象,只能每次调用next来获取下一个对象。此时就适合创建个list,然后每次用append()方法来加入元素。例如:

PyObject *retlist=PyList_New(0);    //创建长度为0的队列
while(pos) {
    PyList_Append(retlist, Py_BuildValue("{}"));
    pos=pos->next;
}

字典也可以用于返回一个单独的结构体内容。即将C/C++结构体中每个字段作为字典中的一个元素来设置,并返回。这种方式的可读性会很好。

使用dict存储信息的例子,key使用字符串:

PyObject *fmtinfo=PyDict_New();
PyDict_SetItemString(fmtinfo, "index", PyInt_FromLong(1));

但是不建议用于返回list中的dict,毕竟性能消耗较多。对于返回多个结构体,更适合的方式还是list中的tuple。

返回内容长度可预估的情况下使用 Py_BuildValue() 更合适。

对于不需要理解内容的字符串,可以使用buffer类型,会比str类型更节省内存和性能。buffer类型相对于str类型的区别是,buffer不会检查系统中内容相同的两个字符串。而str会确保系统里不会有重复的字符串。这个计算过程也是要耗时间的。

新建buffer,获取其指针后进行操作的例子:

Py_ssize_t buflen=1000,_buflen;
void *bufptr;
PyObject *buf=PyBuffer_New(buflen);
if (PyObject_AsWriteBuffer(buf, &bufptr, &_buflen)<0) {
    return NULL;
}

 

5.  异常处理、引用计数

5.1   抛出异常

用来通知Python,在函数里出现了错误。几个常用的内置异常:

    PyExc_ZeroDivisionError :被0除
    PyExc_IOError :IO错误
    PyExc_TypeError :类型错误,如参数类型不对
    PyExc_ValueError :值的范围错误
    PyExc_RuntimeError :运行时错误
    PyExc_OSError :各种与OS交互时的错误

可以根据自己的喜好来抛出异常。实际抛出异常的方法如:

if (ret<0) {
    PyErr_SetString(PyExc_RuntimeError,"Runtime failed!");
    return NULL;
}

有时希望抛出的异常包含一些参数,比如错误码,来方便更好的调试。可以用如下方法:

if (ret<0) {
    PyErr_Format(PyExc_OSError, "ERROR[%d]=%s",
            errno, strerror(errno));
}

各种C/C++库里大量使用了错误码,所以如上方法的使用非常广泛。在Python里看到函数出错抛出的异常,并包含了错误码是比平时写纯C/C++程序动则crash要美好的多。而编写扩展模块的过程使得这个工作规范化了。

5.2   引用计数

扩展模块的引用计数是很魔幻的,也是广为诟病的一个问题。

实际使用中,每个Python API都会在文档里注明其对引用计数的操作。借用就是不改变引用计数,而引用则是会增加1的。

为了避免每次都恶心的去查找这些内容,可以利用一些友好的函数。比如 Py_BuildValue() 直接传入的就是C/C++的数据,其内负责生成复杂的数据结构,并管理好引用计数。

tuple、buffer的引用计数管理也比list、str的要简单,推荐使用。

6.   GIL与多线程

GIL是限制Python使用多核心的直接原因,根本原因是Python解释器内部有一些全局变量,典型如异常处理。而又有很多Python API和第三方模块在使用这些全局变量,使得GIL的改进一直得不到进展。

在扩展模块层面是可以释放GIL的,使得CPU控制权交还给Python,而当前C/C++代码也可以继续执行。但务必注意的是任何Python API的调用都必须在GIL控制下进行。所以在执行密集计算的任务前释放GIL,完成计算后,重新申请GIL,再进行返回值和异常处理。

在扩展模块的函数里释放和申请GIL的第一种写法:

static PyObject *fun(PyObject *self, PyObject *args) {
    //....
    PyThreadState *_save;
    _save=PyEval_SaveThread();
    block();
    PyEval_RestoreThread(_save);
    //...
}

该方法还需要在模块初始化时调用 PyEval_InitThreads() 。

另一种方法则简便的多:

Py_BEGIN_ALLOW_THREADS;
//可能阻塞的操作
Py_END_ALLOW_THREADS;

所以,一种简单的使用多核计算的方法是,把任务拆分成多个小份,每个小份都放在一个线程中运行。线程里调用扩展模块中的计算函数,计算函数在实际计算时释放GIL。

这种方式可以有效的利用Python来管理线程,而无需在C/C++里使用pthread之类的麻烦事,只需要最简单的做计算就好了。

posted on 2018-01-26 10:07  reedlau  阅读(301)  评论(0编辑  收藏  举报

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