系统出现大量不可中断进程与僵尸进程

进程状态

当 iowait 升高时,进程很可能因为得不到硬件的响应,而长时间处于不可中断状态。从 ps 或者 top 命令的输出中,它们都处于 D 状态,也就是不可中断状态;

top 和 ps 是最常用的查看进程状态的工具,下面是一个 top 命令输出的示例,S 列(也就是 Status  列)表示进程的状态。

$ top
  PID USER      PR  NI    VIRT    RES    SHR S  %CPU %MEM     TIME+ COMMAND
28961 root      20   0   43816   3148   4040 R   3.2  0.0   0:00.01 top
  620 root      20   0   37280  33676    908 D   0.3  0.4   0:00.01 app
    1 root      20   0  160072   9416   6752 S   0.0  0.1   0:37.64 systemd
 1896 root      20   0       0      0      0 Z   0.0  0.0   0:00.00 devapp
    2 root      20   0       0      0      0 S   0.0  0.0   0:00.10 kthreadd
    4 root       0 -20       0      0      0 I   0.0  0.0   0:00.00 kworker/0:0H
    6 root       0 -20       0      0      0 I   0.0  0.0   0:00.00 mm_percpu_wq
    7 root      20   0       0      0      0 S   0.0  0.0   0:06.37 ksoftirqd/0

R 是 Running 或 Runnable 的缩写,表示进程在 CPU 的就绪队列中,正在运行或者正在等待运行。

D 是 Disk Sleep 的缩写,也就是不可中断状态睡眠(Uninterruptible Sleep),一般表示进程正在跟硬件交互,并且交互过程不允许被其他进程或中断打断

Z 是 Zombie 的缩写,它表示僵尸进程,也就是进程实际上已经结束了,但是父进程还没有回收它的资源(比如进程的描述符、PID 等)。

S 是 Interruptible Sleep 的缩写,也就是可中断状态睡眠,表示进程因为等待某个事件而被系统挂起。当进程等待的事件发生时,它会被唤醒并进入 R 状态。

I 是 Idle 的缩写,也就是空闲状态,用在不可中断睡眠的内核线程上。前面说了,硬件交互导致的不可中断进程用 D 表示,但对某些内核线程来说,它们有可能实际上并没有任何负载,用 Idle 正是为了区分这种情况。要注意,D 状态的进程会导致平均负载升高, I 状态的进程却不会。

进程还包括下面这 2 个状态。

第一个是 T 或者 t,也就是 Stopped 或 Traced 的缩写,表示进程处于暂停或者跟踪状态。向一个进程发送 SIGSTOP 信号,它就会因响应这个信号变成暂停状态(Stopped);再向它发送 SIGCONT 信号,进程又会恢复运行(如果进程是终端里直接启动的,则需要你用 fg 命令,恢复到前台运行)。而当使用调试器(如 gdb)调试一个进程时,在使用断点中断进程后,进程就会变成跟踪状态,这其实也是一种特殊的暂停状态,只不过你可以用调试器来跟踪并按需要控制进程的运行。

另一个是 X,也就是 Dead 的缩写,表示进程已经消亡,所以你不会在 top 或者 ps 命令中看到它。

S 表示可中断睡眠状态

D 表示不可中断睡眠状态

s 表示这个进程是一个会话的领导进程

+ 表示前台进程组。

进程组表示一组相互关联的进程,比如每个子进程都是父进程所在组的成员;而会话是指共享同一个控制终端的一个或多个进程组。

不可中断状态,这其实是为了保证进程数据与硬件状态一致,并且正常情况下,不可中断状态在很短时间内就会结束。所以,短时的不可中断状态进程,我们一般可以忽略。

僵尸进程,这是多进程应用很容易碰到的问题。正常情况下,当一个进程创建了子进程后,它应该通过系统调用 wait() 或者 waitpid() 等待子进程结束,回收子进程的资源;而子进程在结束时,会向它的父进程发送 SIGCHLD 信号,所以,父进程还可以注册 SIGCHLD 信号的处理函数,异步回收资源。如果父进程没这么做,或是子进程执行太快,父进程还没来得及处理子进程状态,子进程就已经提前退出,那这时的子进程就会变成僵尸进程。

通常,僵尸进程持续的时间都比较短,在父进程回收它的资源后就会消亡;或者在父进程退出后,由 init 进程回收后也会消亡。一旦父进程没有处理子进程的终止,还一直保持运行状态,那么子进程就会一直处于僵尸状态。大量的僵尸进程会用尽 PID 进程号,导致新进程不能创建,所以这种情况一定要避免。

示例,不同的系统运行可能IO会有一些差异

 docker run --privileged --name=app -itd feisky/app:iowait

用 top  看一下系统的资源使用情况

# 按下数字 1 切换到所有 CPU 的使用情况,观察一会儿按 Ctrl+C 结束
$ top
top - 05:56:23 up 17 days, 16:45,  2 users,  load average: 2.00, 1.68, 1.39
Tasks: 247 total,   1 running,  79 sleeping,   0 stopped, 115 zombie
%Cpu0  :  0.0 us,  0.7 sy,  0.0 ni, 38.9 id, 60.5 wa,  0.0 hi,  0.0 si,  0.0 st
%Cpu1  :  0.0 us,  0.7 sy,  0.0 ni,  4.7 id, 94.6 wa,  0.0 hi,  0.0 si,  0.0 st
...

  PID USER      PR  NI    VIRT    RES    SHR S  %CPU %MEM     TIME+ COMMAND
 4340 root      20   0   44676   4048   3432 R   0.3  0.0   0:00.05 top
 4345 root      20   0   37280  33624    860 D   0.3  0.0   0:00.01 app
 4344 root      20   0   37280  33624    860 D   0.3  0.4   0:00.01 app
    1 root      20   0  160072   9416   6752 S   0.0  0.1   0:38.59 systemd
...

  先看第一行的平均负载( Load Average),过去 1 分钟、5 分钟和 15 分钟内的平均负载在依次减小,说明平均负载正在升高;而 1 分钟内的平均负载已经达到系统的 CPU 个数,说明系统很可能已经有了性能瓶颈。

再看第二行的 Tasks,有 1 个正在运行的进程,但僵尸进程比较多,而且还在不停增加,说明有子进程在退出时没被清理。

接下来看两个 CPU 的使用率情况,用户 CPU 和系统 CPU 都不高,但 iowait 分别是 60.5% 和 94.6%,好像有点儿不正常。

最后再看每个进程的情况, CPU 使用率最高的进程只有 0.3%,看起来并不高;但有两个进程处于 D 状态,它们可能在等待 I/O,但光凭这里并不能确定是它们导致了 iowait 升高。

暴露两个问题

第一点,iowait 太高了,导致系统的平均负载升高,甚至达到了系统 CPU 的个数。

第二点,僵尸进程在不断增多,说明有程序没能正确清理子进程的资源。

查询系统的 I/O 情况。使用dstat ,它的好处是,可以同时查看 CPU 和 I/O 这两种资源的使用情况

# 间隔1秒输出10组数据
$ dstat 1 10
You did not select any stats, using -cdngy by default.
--total-cpu-usage-- -dsk/total- -net/total- ---paging-- ---system--
usr sys idl wai stl| read  writ| recv  send|  in   out | int   csw
  0   0  96   4   0|1219k  408k|   0     0 |   0     0 |  42   885
  0   0   2  98   0|  34M    0 | 198B  790B|   0     0 |  42   138
  0   0   0 100   0|  34M    0 |  66B  342B|   0     0 |  42   135
  0   0  84  16   0|5633k    0 |  66B  342B|   0     0 |  52   177
  0   3  39  58   0|  22M    0 |  66B  342B|   0     0 |  43   144
  0   0   0 100   0|  34M    0 | 200B  450B|   0     0 |  46   147
  0   0   2  98   0|  34M    0 |  66B  342B|   0     0 |  45   134
  0   0   0 100   0|  34M    0 |  66B  342B|   0     0 |  39   131
  0   0  83  17   0|5633k    0 |  66B  342B|   0     0 |  46   168
  0   3  39  59   0|  22M    0 |  66B  342B|   0     0 |  37   134

  从 dstat 的输出,可以看到,每当 iowait 升高(wai)时,磁盘的读请求(read)都会很大。这说明 iowait 的升高跟磁盘的读请求有关,很可能就是磁盘读导致的。

运行 top 命令,观察 D 状态的进程:

# 观察一会儿按 Ctrl+C 结束
$ top
...
  PID USER      PR  NI    VIRT    RES    SHR S  %CPU %MEM     TIME+ COMMAND
 4340 root      20   0   44676   4048   3432 R   0.3  0.0   0:00.05 top
 4345 root      20   0   37280  33624    860 D   0.3  0.0   0:00.01 app
 4344 root      20   0   37280  33624    860 D   0.3  0.4   0:00.01 app
...

  从 top 的输出找到 D 状态进程的 PID,可以发现,这个界面里有两个 D 状态的进程,PID 分别是 4344 和 4345。

在终端里运行下面的 pidstat 命令,并用 -p 4344 参数指定进程号:

# -d 展示 I/O 统计数据,-p 指定进程号,间隔 1 秒输出 3 组数据
$ pidstat -d -p 4344 1 3
06:38:50      UID       PID   kB_rd/s   kB_wr/s kB_ccwr/s iodelay  Command
06:38:51        0      4344      0.00      0.00      0.00       0  app
06:38:52        0      4344      0.00      0.00      0.00       0  app
06:38:53        0      4344      0.00      0.00      0.00       0  app

  在这个输出中,  kB_rd 表示每秒读的 KB 数, kB_wr 表示每秒写的 KB 数,iodelay 表示 I/O 的延迟(单位是时钟周期)。它们都是 0,那就表示此时没有任何的读写,说明问题不是 4344 进程导致的。

可是,用同样的方法分析进程 4345,会发现,它也没有任何磁盘读写。继续使用 pidstat,但这次去掉进程号,干脆就来观察所有进程的 I/O 使用情况。

# 间隔 1 秒输出多组数据 (这里是 20 组)
$ pidstat -d 1 20
...
06:48:46      UID       PID   kB_rd/s   kB_wr/s kB_ccwr/s iodelay  Command
06:48:47        0      4615      0.00      0.00      0.00       1  kworker/u4:1
06:48:47        0      6080  32768.00      0.00      0.00     170  app
06:48:47        0      6081  32768.00      0.00      0.00     184  app

06:48:47      UID       PID   kB_rd/s   kB_wr/s kB_ccwr/s iodelay  Command
06:48:48        0      6080      0.00      0.00      0.00     110  app

06:48:48      UID       PID   kB_rd/s   kB_wr/s kB_ccwr/s iodelay  Command
06:48:49        0      6081      0.00      0.00      0.00     191  app

06:48:49      UID       PID   kB_rd/s   kB_wr/s kB_ccwr/s iodelay  Command

06:48:50      UID       PID   kB_rd/s   kB_wr/s kB_ccwr/s iodelay  Command
06:48:51        0      6082  32768.00      0.00      0.00       0  app
06:48:51        0      6083  32768.00      0.00      0.00       0  app

06:48:51      UID       PID   kB_rd/s   kB_wr/s kB_ccwr/s iodelay  Command
06:48:52        0      6082  32768.00      0.00      0.00     184  app
06:48:52        0      6083  32768.00      0.00      0.00     175  app

06:48:52      UID       PID   kB_rd/s   kB_wr/s kB_ccwr/s iodelay  Command
06:48:53        0      6083      0.00      0.00      0.00     105  app
...

  观察一会儿可以发现,的确是 app 进程在进行磁盘读,并且每秒读的数据有 32 MB,看来就是 app 的问题。这里,进程想要访问磁盘,就必须使用系统调用,所以接下来,重点就是找出  app 进程的系统调用了。

strace  正是最常用的跟踪进程系统调用的工具。所以,我们从 pidstat 的输出中拿到进程的 PID 号,比如 6082,然后在终端中运行 strace 命令,并用 -p 参数指定 PID 号:

$ strace -p 6082
strace: attach: ptrace(PTRACE_SEIZE, 6082): Operation not permitted

  strace 命令居然失败了,并且命令报出的错误是没有权限。一般遇到这种问题时,先检查一下进程的状态是否正常。比如,继续在终端中运行 ps 命令,并使用 grep 找出刚才的 6082 号进程:

$ ps aux | grep 6082
root      6082  0.0  0.0      0     0 pts/0    Z+   13:43   0:00 [app] <defunct>

  进程 6082 已经变成了 Z 状态,也就是僵尸进程。僵尸进程都是已经退出的进程,所以就没法儿继续分析它的系统调用。

系统 iowait 的问题还在继续,但是  top、pidstat  这类工具已经不能给出更多的信息了。可以用  perf top 看看有没有新发现。再或者,在终端中运行 perf record,持续一会儿(例如 15 秒),然后按 Ctrl+C 退出,再运行 perf report 查看报告:

$ perf record -g
$ perf report

  接着,找到我们关注的 app 进程,按回车键展开调用栈,

 

可以发现, app 的确在通过系统调用 sys_read() 读取数据。并且从 new_sync_read 和 blkdev_direct_IO  能看出,进程正在对磁盘进行直接读,也就是绕过了系统缓存,每个读请求都会从磁盘直接读,这就可以解释观察到的 iowait 升高了。app 内部进行了磁盘的直接 I/O 啊!找到问题的代码修复就好

再用 top 检查一下:

$ top
top - 14:59:32 up 19 min,  1 user,  load average: 0.15, 0.07, 0.05
Tasks: 137 total,   1 running,  72 sleeping,   0 stopped,  12 zombie
%Cpu0  :  0.0 us,  1.7 sy,  0.0 ni, 98.0 id,  0.3 wa,  0.0 hi,  0.0 si,  0.0 st
%Cpu1  :  0.0 us,  1.3 sy,  0.0 ni, 98.7 id,  0.0 wa,  0.0 hi,  0.0 si,  0.0 st
...

  PID USER      PR  NI    VIRT    RES    SHR S  %CPU %MEM     TIME+ COMMAND
 3084 root      20   0       0      0      0 Z   1.3  0.0   0:00.04 app
 3085 root      20   0       0      0      0 Z   1.3  0.0   0:00.04 app
    1 root      20   0  159848   9120   6724 S   0.0  0.1   0:09.03 systemd
    2 root      20   0       0      0      0 S   0.0  0.0   0:00.00 kthreadd
    3 root      20   0       0      0      0 I   0.0  0.0   0:00.40 kworker/0:0
...

  僵尸进程还在。仔细观察僵尸进程的数量,你会郁闷地发现,僵尸进程还在不断的增长中。

接下来,我们就来处理僵尸进程的问题。既然僵尸进程是因为父进程没有回收子进程的资源而出现的,也就是要找出父进程,然后在父进程里解决。

ps -aux | grep Z
USER       PID %CPU %MEM    VSZ   RSS TTY      STAT START   TIME COMMAND

root     15714  0.0  0.0      0     0 pts/0    Z+   19:57   0:00 [app] <defunct>
root     15715  0.0  0.0      0     0 pts/0    Z+   19:57   0:00 [app] <defunct>
root     15716  0.0  0.0      0     0 pts/0    Z+   19:57   0:00 [app] <defunct>
root     15718  0.0  0.0 112728   972 pts/0    R+   19:57   0:00 grep --color=auto Z
[root@linux-xingnengyouhua ~]# pstree | grep app
        |-containerd-+-containerd-shim-+-app---50*[app]
[root@linux-xingnengyouhua ~]# pstree -aps 15716
systemd,1 --switched-root --system --deserialize 22
  └─containerd,5515
      └─containerd-shim,15626 -namespace moby -workdir /var/lib/containerd/io.containerd.runtime.v1.linux/moby/9424f80735a14e301c5eb7df72cd2751db090d6e657319f47d6bd47b94e70a65 -address...
          └─app,15643 -d /dev/sda1 -s 37108864 -c 20
              └─(app,15716)

  查看 app 应用程序的代码,看看子进程结束的处理是否正确,比如有没有调用 wait() 或 waitpid() ,抑或是,有没有注册 SIGCHLD 信号的处理函数。

int status = 0;
  for (;;) {
    for (int i = 0; i < 2; i++) {
      if(fork()== 0) {
        sub_process();
      }
    }
    sleep(5);
  }

  while(wait(&status)>0);

  

循环语句本来就容易出错,这段代码虽然看起来调用了 wait() 函数等待子进程结束,但却错误地把 wait() 放到了 for 死循环的外面,也就是说,wait() 函数实际上并没被调用到
修改后重启查看

$ top
top - 15:00:44 up 20 min,  1 user,  load average: 0.05, 0.05, 0.04
Tasks: 125 total,   1 running,  72 sleeping,   0 stopped,   0 zombie
%Cpu0  :  0.0 us,  1.7 sy,  0.0 ni, 98.3 id,  0.0 wa,  0.0 hi,  0.0 si,  0.0 st
%Cpu1  :  0.0 us,  1.3 sy,  0.0 ni, 98.7 id,  0.0 wa,  0.0 hi,  0.0 si,  0.0 st
...

  PID USER      PR  NI    VIRT    RES    SHR S  %CPU %MEM     TIME+ COMMAND
 3198 root      20   0    4376    840    780 S   0.3  0.0   0:00.01 app
    2 root      20   0       0      0      0 S   0.0  0.0   0:00.00 kthreadd
    3 root      20   0       0      0      0 I   0.0  0.0   0:00.41 kworker/0:0
...

  

 

posted @ 2020-08-23 20:32  烟雨楼台,行云流水  阅读(585)  评论(0编辑  收藏  举报