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ranXU
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2023年4月29日
Plink中,BGEN格式的数据如何用
摘要: 这里,介绍一下BGEN格式的数据,他的文件格式是这样的:a.bgen,这是一个新的数据格式,目前应用不如plink的二进制文件:.bim,.bed,.fam。这里介绍一下如何相互转换。 1. bgen格式介绍现代遗传关联研究通常使用数万至数十万个体的数据,这些数据是全基因组数千万标记的基因分型或估算
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posted @ 2023-04-29 20:32 RanXu95
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2023年4月28日
R语言,dotplot的使用
摘要: 一步步绘制和美化dot plot简介开始1. 查看数据并转换为长数据格式2. 绘制基础图形3. 添加errorbar和pointrange4. 修改颜色和坐标轴主题5. 加注释总结简介作为文章中经常出现的一种图形,dot plot 可以展示点的分布和统计变化之后的数据均值等特征值。以下是一篇已发表的
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posted @ 2023-04-28 11:38 RanXu95
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R语言,从某个文件中批量提取
摘要: # 从c文件中提取信息:c文件中c文件A行和b文件D行一样的 data <- c[which((c$A)%in%b$D),]
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posted @ 2023-04-28 07:59 RanXu95
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2023年4月27日
R语言,如何多个表逐列合并
摘要: 将NN和AA两个Sheet相同列的数据放到一个表格中 #0读取数据 df1<- read_excel("all_data.xlsx",sheet="NN") df2<- read_excel("all_data.xlsx",sheet="AA") #1处理为每一年一个csv文件 for (i in
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posted @ 2023-04-27 03:25 RanXu95
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