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摘要: Blast进行同源基因的寻找 参考博客: http://boyun.sh.cn/bio/?p=1849 https://www.bioinfo scrounger.com/archives/673/ 基于蛋白的比对结果,寻找某一个蛋白家族的同源基因,使用如下的参数 identity 30%; e v 阅读全文
posted @ 2020-03-06 10:00 raisok 阅读(3070) 评论(1) 推荐(1) 编辑
摘要: 目的 对不同处理的基因的表达量进行差异分析 使用python的scipy包进行t检验 导入统计包 from scipy import stats 单样本的T检验(ttest_1samp) stats.ttest_1samp(data,1) 两独立样本T检验(ttest_ind) 当两个总体方差相等时,即具有方差齐性,可以直接检验 stats.ttest_ind(data1,da... 阅读全文
posted @ 2020-01-21 11:48 raisok 阅读(1148) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 环境部署 环境部署需要安装python,这里已经配置好,略过 首先登陆kaggle 下载titanic数据 https://www.kaggle.com/c/titanic/data 点击Download ALL 查看数据 gender test.csv train.csv 开始建模 import pandas as pd import os from skle... 阅读全文
posted @ 2020-01-21 11:47 raisok 阅读(555) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 参考博客: "https://www.ruanyifeng.com/blog/2011/08/bayesian_inference_part_one.html" 贝叶斯的介绍 贝叶斯本质就一个条件概率公式P(A|B),也就是在B事件发生的情况下,A事件发生的概率。贝叶斯推断是一种统计学方法,用来估量 阅读全文
posted @ 2020-01-21 11:42 raisok 阅读(1310) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 参考博客 "http://blog.sciencenet.cn/blog 3406804 1166293.html" 四个参数用于控制坐标轴与作图区域的位置 scale_x_discrete(expand = c(0, 0)) scale_y_discrete(expand = c(0, 0)) s 阅读全文
posted @ 2020-01-21 11:37 raisok 阅读(2245) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 这里介绍两种不同的配置方法,一种是通过docker,一种是直接ISO进行安装,一种是直接yum install 安装,三种安装方法均需要使用root权限 参考博客:http://yxnchen.github.io/technique/Docker部署ShareLaTeX并简单配置中文环境/ 参考博客 阅读全文
posted @ 2019-12-25 08:03 raisok 阅读(4905) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 下载centos7 镜像并制作U盘启动盘 从清华镜像源进行下载 设置U盘为第一启动项 开机F9可以进入BIOS设置 {{uploading image 412605.png(uploading...)}} 系统环境搭建 系统版本如下: CentOS Linux release 7.7.1908 (C 阅读全文
posted @ 2019-12-25 08:02 raisok 阅读(4593) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 可参考博客: "http://blog.csdn.net/carzyer/article/details/5117429" Perl常用命令行参数概览 e 指定字符串以作为脚本(多个字符串迭加)执行 M/ m 和 use 模块名 一样. 如果不想引入模块的缺省值, 你可以使用 m. m模块名 和 u 阅读全文
posted @ 2019-12-05 15:42 raisok 阅读(407) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: perl修改源地址 这里推荐中科大的源 perl MCPAN e shell 1、执行cpan命令确认存在该命令 如果cpan执行后提示找不到该命令,可以通过 或手动安装该模块。 首次执行会出现yes/no的界面,输入yes会自动配置,输入no会让手动的配置一些参数。这里我选择了yes,配置好后的配 阅读全文
posted @ 2019-12-05 15:41 raisok 阅读(2723) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 什么是pandas pandas是一个python的包,主要用来处理表格格式的文件,可以快速的对表格进行查询,过滤,合并等操作。 pandas的简单使用 pandas读入table格式文件 pandas写出文件 读取指定的两列 将读取的两列存为一个字典 阅读全文
posted @ 2019-12-05 15:40 raisok 阅读(493) 评论(0) 推荐(0) 编辑
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