摘要：
软件介绍 软件安装 R版本 library(devtools) install_github("velocyto-team/velocyto.R") 需要安装hdf5，详细见hdf5的安装 然后报错，需要安装pcaMethods BiocManager::install("pcaMethods") 阅读全文
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输入文件格式 处理之后的输入格式 使用脚本 使用命令 输出文件结果 输出文件格式 阅读全文
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软件介绍 SENIC 是一种同时重建基因调控网络并从单细胞RNA seq数据中鉴定stable cell states的工具。基于共表达和DNA模基序 （motif）分析推断基因调控网络 ，然后在每个细胞中分析网络活性以鉴定细胞状态 https://www.nature.com/articles/n 阅读全文
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软件下载 BLAST+的一般用法如下： 格式化数据库 参数说明: in：待格式化的序列文件 dbtype：数据库类型，prot或nucl out：数据库名 蛋白序列比对蛋白数据库（blastp） 参数说明: query： 输入文件路径及文件名 out：输出文件路径及文件名 db：格式化了的数据库路径 阅读全文
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Blast进行同源基因的寻找 参考博客： http://boyun.sh.cn/bio/?p=1849 https://www.bioinfo scrounger.com/archives/673/ 基于蛋白的比对结果，寻找某一个蛋白家族的同源基因，使用如下的参数 identity 30%； e v 阅读全文