安装R包常见的方法

  1. 首先尝试从 CRAN 安装:
    直接安装

    install.packages("test")
    

    带参数的(加上lib参数可以指定自定义库路径)

    install.packages("https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/Matrix/Matrix_1.6-1.1.tar.gz", repos = NULL)
    
  2. 如果从 CRAN 安装失败,尝试从 Bioconductor 安装:

    BiocManager::install("test")
    
  3. 如果以上两种方法都不行,尝试从 GitHub 安装:

    devtools::install_github("example/test")
    
  4. 在 Ubuntu 环境下从 GitHub 克隆并安装 R 包:

    1. 从 GitHub 克隆代码:

      git clone https://github.com/example/test.git
      

      克隆目录为 /root/packages

    2. 进入克隆的目录:

      cd /root/packages/test
      

      创建 .tar.gz 文件:

      R CMD build .
      

      这将生成一个 .tar.gz 文件,比如 test_1.0.tar.gz

    3. 安装压缩包的 R 包:

      install.packages("/root/packages/test/test_1.0.tar.gz", repos = NULL, type = "source")
      

    注意:"example/test" 是具体的 GitHub 路径,请确保这是正确的路径。
    在 4. 中可以 直接切换到目录后进入 R 进行安装
    install.packages(".", repos = NULL, type = "source")

posted @ 2024-08-29 13:51  rainsc  阅读(53)  评论(0编辑  收藏  举报