摘要: ggplot2分组时默认使用的颜色,可以从另一个hadley写的包,scales包中调用。这个包算是一个工具包,用于和hadley写的其他包配合使用,颜色是其中一部分。 hue_pal函数的默认设置,其中h是色相,范围越大,相邻颜色之间差异越大;c是饱和度,值越大色彩越浓艳饱满;l是亮度,大亮小暗。 阅读全文
posted @ 2019-08-21 09:59 qinqinyang 阅读(6612) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: We can just as easily write a function to go from human to mouse genes. 阅读全文
posted @ 2019-07-04 17:48 qinqinyang 阅读(698) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: unset PYTHONPATH echo $PYTHONPATH 代码里面提到的软件,都是根据我们对ATAC-seq搜索学习总结的。 值得一提的是自己为了ATAC-seq建立的软件环境可以很方便移植到另外一台电脑! 首先通过activate target_env要分享的环境target_env,然 阅读全文
posted @ 2018-12-12 10:34 qinqinyang 阅读(2224) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 输入数据如下: 分组计数 阅读全文
posted @ 2018-11-07 14:11 qinqinyang 阅读(7000) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: MAC电脑R语言路径不显示中文,可以设置显示为UTF-8 阅读全文
posted @ 2018-11-02 14:26 qinqinyang 阅读(1842) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: R 阅读全文
posted @ 2018-08-14 17:39 qinqinyang 阅读(693) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 1.从bam文件中提取位点的测序深度 samtools depth -b intervals.bed 1.bam intervals.bed文件包括需要提取的位点 chr1 39717581 chr1 39898741 chr1 40928207 chr1 91405097 chr1 9922562 阅读全文
posted @ 2018-07-18 17:44 qinqinyang 阅读(197) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 简单的把过程写一下: 1.备份ssh.plist: cp /System/Library/LaunchDaemons/ssh.plist /Library/LaunchDaemons/ssh2.plist chmod o+w /Library/LaunchDaemons/ssh2.plist vim 阅读全文
posted @ 2018-05-08 17:34 qinqinyang 阅读(1376) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: fasta序列: >ORF type:5prime_partial len:117 (+) 2T_between1k2k_c100001_f2p26_1105:1-351(+)CCCCAGGACATGAAGGGTGCCTCTCGAAGCCCCGAAGACAGCAGTCCGGATGCCGCCCGCAT 阅读全文
posted @ 2017-11-27 14:47 qinqinyang 阅读(485) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 1.可能是系统版本太老的问题解决办法换新系统2.可能是apt源的问题在/etc/apt目录下面有一个source.list文件,修改它,在后面加上下面几个源或者选择性加入 #官方源: 执行 sudo apt-get update 再安装试试 亲测有效。 作者:sarleon链接:https://ww 阅读全文
posted @ 2017-10-13 09:45 qinqinyang 阅读(2014) 评论(1) 推荐(0) 编辑