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2014年8月25日
正则表达式
摘要: 1.1简介1.2. 数量词的贪婪模式与非贪婪模式正则表达式通常用于在文本中查找匹配的字符串。Python里数量词默认是贪婪的(在少数语言里也可能是默认非贪婪),总是尝试匹配尽可能多的字符;非贪婪的则相反,总是尝试匹配尽可能少的字符。例如:正则表达式"ab*"如果用于查找"abbbc",将找到"abb...
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posted @ 2014-08-25 11:15 凉皮子
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2014年8月24日
module
摘要: 定义:模块可把一个复杂的程序按功能分开,分别存放到不同的文件中,是程序更容易维护和管理。在python中的模块是一个以.py结尾的python代码文件。模块的使用:可通过import命令输入,import os或import os,sysimport会完成以下三个操作:创建新的名称空间,该名称空间中...
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posted @ 2014-08-24 21:53 凉皮子
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2014年8月23日
Samtools的使用方法
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posted @ 2014-08-23 21:25 凉皮子
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2014年8月22日
Variant Call Format(VCF)
摘要: IntroductionVCF is a text file format (most likely stored in a compressed manner). It contains meta-information lines, a header line, and then data li...
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posted @ 2014-08-22 15:35 凉皮子
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2014年8月21日
awk使用方法
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posted @ 2014-08-21 09:34 凉皮子
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2014年8月20日
os.path模块
摘要: os.path.abspath(path) #返回绝对路径os.path.basename(path) #返回文件名os.path.commonprefix(list) #返回list(多个路径)中,所有path共有的最长的路径。os.path.dirname(path) #返回文件路径os.pat...
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posted @ 2014-08-20 10:32 凉皮子
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Vim常用命令
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posted @ 2014-08-20 10:11 凉皮子
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2014年8月19日
python对文件的处理
摘要: 文件对象的访问模式:r 以读方式打开rU 以读方式打开,同时提供通用换行符支持w 以写方式打开a 以追加模式打开 (从 EOF 开始, 必要时创建新文件)r+ 以读写模式打开w+ 以读写模式打开 (参见 w )a+ 以读写模式打开 (参见 a )rb 以二进制读模式打开wb 以二进制写模式打开 (参...
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posted @ 2014-08-19 16:30 凉皮子
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