摘要：
Samtools merge 时出错：弄了个软链接，如图2，使用链接过去的文件时出现图1的错误，主要是软链接的时候没有全部提供绝对路径。出现以下错误，是因为事先没提前对bam文件进行sort,genomeCoverageBed中的输入文件同样需要经过排序，如若是bed，则须用sort排序，如若是ba... 阅读全文
摘要：
有很多种格式来记录mapping的结果，大多数都收录在UCSC的帮助文档中。在mapping之后，如何对mapping的结果进行评估呢？ 最简单的，就是通过samtools来评估mapping质量了。samtools idxstats aln.sorted.bam注意，这一步之前需要经过sort和i... 阅读全文