树的可视化

networkx虽然提供了基于树的接口,但是对于树这种特殊结构没有良好的构建、显示功能,一切还是基于图来处理的,比如一个简单的二叉树会画成这样:

# -*- encoding: utf-8 -*-

from matplotlib import pyplot as plt
import networkx as nx

T = nx.balanced_tree(2, 3)
nx.draw(T, with_labels=True)
plt.show()

tree

找了下,发现一个专门针对Tree的Python库ETE2,有很多针对树的数据读写、计算的函数。但是绘图函数很丑,凑合用下吧。

# -*- encoding: utf-8 -*-

from ete2 import Tree, TreeStyle

T = Tree('((A,B),(C),(D,(E,F)));')

style = TreeStyle()
style.mode = 'c'
style.show_scale = False
style.arc_start = -180 # 0 degrees = 3 o'clock
style.arc_span = 180

T.render('tree2.png', w=300, h=300, units='px', tree_style=style)
T.show(tree_style=style)

tree2

posted on 2015-02-28 18:04  openqt  阅读(1596)  评论(0编辑  收藏  举报

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