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摘要: 常用的正常和异常染色体的命名、缩写和符号(ISCN,1978)如下: A-G成 染色体组; 1-22 常染色体序号; X,Y 性染色体; / 用于分开嵌合体不同的细胞系; +,二 放在常染色体号或组的符号之前时,表示整个染色体的增加或丢失;放在染色体壁、结构或其它符号之后时,表示染色体长度的增加或减 阅读全文
posted @ 2018-06-28 10:34 nkwy2012 阅读(751) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 1、背景简介 在数据分析工作中,经常需要对原始的数据集进行清洗、整理以及变换。常用的数据整理与变换工作主要包括:特定分析变量的选取、满足条件的数据记录的筛选、按某一个或几个变量排序、对原始变量进行加工处理并生成新的变量、对数据进行汇总以及分组汇总,比如计算各组的平均值等。 其实,上述的数据处理与变换 阅读全文
posted @ 2018-06-28 08:47 nkwy2012 阅读(739) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 当我们想研究不同sample的某个变量A之间的差异时,往往会因为其它一些变量B对该变量的固有影响,而影响不同sample变量A的比较,这个时候需要对sample变量A进行标准化之后才能进行比较。标准化的方法是对sample 的 A变量和B变量进行loess回归,拟合变量A关于变量B的函数 f(b), 阅读全文
posted @ 2018-06-26 19:36 nkwy2012 阅读(913) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: 在linux中,通常用命令行打开文本文件,比如用命令gedit、more、cat、vim、less。但当需要打开其他格式文件时,比如pdf、jpg、mp3格式文件,咱们通常做法是进入到文件所在的目录,双击打开,很影响效率。事实上,可以通过命令xdg-open(opens a file or URL 阅读全文
posted @ 2018-06-26 19:35 nkwy2012 阅读(1022) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: vcf文件的全称是variant call file,即突变识别文件,它是基因组工作流程中产生的一种文件,保存的是基因组上的突变信息。通过对vcf文件进行分析,可以得到个体的变异信息。嗯,总之,这是很重要的文件,所以怎么处理它也显得十分重要。它的文件信息如下: 文件的开头是一堆以“##”开始的注释行 阅读全文
posted @ 2018-06-20 15:36 nkwy2012 阅读(3762) 评论(1) 推荐(1) 编辑
摘要: 一、IFS 介绍 Shell 脚本中有个变量叫 IFS(Internal Field Seprator) ,内部域分隔符。完整定义是The shell uses the value stored in IFS, which is the space, tab, and newline charact 阅读全文
posted @ 2018-06-20 11:25 nkwy2012 阅读(340) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 命令:let let 命令是 BASH 中用于计算的工具,用于执行一个或多个表达式,变量计算中不需要加上 $ 来表示变量。如果表达式中包含了空格或其他特殊字符,则必须引起来。 语法格式 参数说明: arg:要执行的表达式 实例: 自加操作:let no++ 自减操作:let no-- 简写形式 le 阅读全文
posted @ 2018-06-20 11:16 nkwy2012 阅读(528) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: $hash{"A"}=["pp"];想变成:$hash{"A"}=["p","q"];因为 $hash{'A'} 是个 arrayref 所以 push 的时候需要解引用 push @{$hash{'A'}}, 'q'; 阅读全文
posted @ 2018-06-14 10:04 nkwy2012 阅读(984) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: http://www.runoob.com/perl/perl-cgi-programming.html 什么是CGI CGI 目前由NCSA维护,NCSA定义CGI如下: CGI(Common Gateway Interface),通用网关接口,它是一段程序,运行在服务器上如:HTTP服务器,提供 阅读全文
posted @ 2018-06-14 08:22 nkwy2012 阅读(2539) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 本文和大家重点讨论一下Perl关联数组的概念,创建Perl关联数组,从数组变量复制到Perl关联数组,元素的增删,用Perl关联数组循环等内容,相信通过本文的学习你对Perl关联数组的用法一定会有深刻的认识。 Perl关联数组 一、创建Perl关联数组 可以用单个赋值语句创建Perl关联数组,如:% 阅读全文
posted @ 2018-06-13 13:55 nkwy2012 阅读(887) 评论(0) 推荐(0) 编辑
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