摘要: http://huttenhower.sph.harvard.edu/galaxy/ 阅读全文
posted @ 2016-12-02 14:48 nkwy2012 阅读(316) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 把下列所有.c的文件名修改为.cc rename .c .cc *.c 阅读全文
posted @ 2016-11-29 16:29 nkwy2012 阅读(2027) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 命令参数: -m, --mode=模式,设定权限<模式> (类似 chmod),而不是 rwxrwxrwx 减 umask -p, --parents 可以是一个路径名称。此时若路径中的某些目录尚不存在,加上此选项后,系统将自动建立好那些尚不存在的目录,即一次可以建立多个目录; -v, --verb 阅读全文
posted @ 2016-11-28 11:13 nkwy2012 阅读(174) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: http://www.molecularevolution.org/resources/activities/QC_of_NGS_data_activity_new table of contents expected learning outcomes getting started exerci 阅读全文
posted @ 2016-11-22 16:41 nkwy2012 阅读(477) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: python -m pip install --trusted-host pypi.python.org 阅读全文
posted @ 2016-11-15 17:02 nkwy2012 阅读(206) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: sratoolkit.2.6.2-centos_linux64/bin/prefetch 下载SRA文件 fastq-dump --split-3 SRR2923014.sra 转成fq文件 阅读全文
posted @ 2016-11-15 17:00 nkwy2012 阅读(491) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 一、ConfigParser简介 ConfigParser 是用来读取配置文件的包。配置文件的格式如下:中括号“[ ]”内包含的为section。section 下面为类似于key-value 的配置内容。 1: [db] 2: db_host = 127.0.0.1 3: db_port = 22 阅读全文
posted @ 2016-11-14 16:59 nkwy2012 阅读(285) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 在python下,获取当前执行主脚本的方法有两个:sys.argv[0]和__file__。 sys.argv[0] 获取主执行文件路径的最佳方法是用sys.argv[0],它可能是一个相对路径,所以再取一下abspath是保险的做法,像这样: import os,sys dirname, file 阅读全文
posted @ 2016-11-14 16:38 nkwy2012 阅读(285) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: http://www.cravat.us/CRAVAT/ 阅读全文
posted @ 2016-11-08 14:50 nkwy2012 阅读(167) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 第一代无创产前诊断是通过染色体倍数异常来判断的,最典型的就是先抽取孕妇的外周血,提取游离DNA,通过高通量测序技术分析每染色体片段,判断胎儿是否是21号三倍体。第二代无创产前诊断分析的是基因突变诊断。 最新这篇文章通过针对母体血浆DNA进行全基因组测序(195×和270×单倍体基因组覆盖),探索无创 阅读全文
posted @ 2016-11-04 16:54 nkwy2012 阅读(1995) 评论(1) 推荐(0) 编辑