nkwy2012

2017年2月14日

摘要：微生物生态（MicrobialEcology），又名环境微生物（Environmental Microbiology），是研究微生物之间及其与环境之间相互关系的学科。从生物角度，其研究对象主要有真核微生物（Eukaryotes，如原生生物、真菌等）、原核微生物（Prokaryotes，细菌和古菌）和阅读全文

posted @ 2017-02-14 10:17 nkwy2012 阅读(30172) 评论(0) 推荐(0) 编辑

sliva数据库简介--转载

摘要： sliva rRNA数据库（http://www.arb-silva.de/）用来检查和比对RNA序列，既可以针对16S/18S,SSU，也可以针对23S/28S, LSU，包括了Bacteria, Archaea and Eukarya。同时也是ARB的官方指定数据库。 LSU: Large su 阅读全文

posted @ 2017-02-14 10:16 nkwy2012 阅读(6840) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2017年2月13日

DriverDBv2---人类肿瘤driver基因数据库

摘要： http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26635391 阅读全文

posted @ 2017-02-13 13:54 nkwy2012 阅读(664) 评论(0) 推荐(0) 编辑

lncrnablog

摘要： http://www.lncrnablog.com/ 阅读全文

posted @ 2017-02-13 13:52 nkwy2012 阅读(165) 评论(0) 推荐(0) 编辑

胞外囊泡与外泌体数据库--转载

摘要： 1.胞外囊泡数据库(EVpedia) 数据库链接:http://evpedia.info 胞外囊泡的分泌是一种普遍的细胞活动这种活动的物种范围从单细胞生物（如古细菌；革兰氏阳性和革兰氏阴性菌）到复杂的多细胞生物体，这些信息表明胞外囊泡调节的细胞间通讯在进化上是保守的。胞外囊泡是一种球状脂质双分子层，阅读全文

posted @ 2017-02-13 13:49 nkwy2012 阅读(2115) 评论(0) 推荐(0) 编辑

Oncomine: 一个肿瘤相关基因研究的数据库--转载

摘要：如果你获得了一个肿瘤差异表达基因，想研究其是否可作为某种肿瘤的潜在标志物和靶点，又怕做实验会得到阴性结果，浪费时间和金钱，这时候你就应该想到Oncomine数据库了(www.oncomine.org)。 Oncomine整合了GEO、TCGA和已发表的文献等来源的RNA和DNA-seq数据，只要你用阅读全文

posted @ 2017-02-13 13:48 nkwy2012 阅读(14259) 评论(0) 推荐(0) 编辑

circRNA研究手册

摘要：环状RNA(circRNA)研究技术手册.doc.pdf （转自：汉恒生物）阅读全文

posted @ 2017-02-13 13:46 nkwy2012 阅读(408) 评论(0) 推荐(0) 编辑

常用Gene ID转换工具--转载

摘要：在自己的研究工作中，经常会遇到一些需要对Gene ID进行转换的情况。目前存在着大量的生物信息数据库，每个数据库都有自己定义的ID命名规则，转换起来实在是一个很大的工作。举个例子，之前构建的Human PPI network, 共选用相关数据库有6个，其中对于蛋白的命名相关的形式多达近10中，耗费了阅读全文

posted @ 2017-02-13 13:44 nkwy2012 阅读(1168) 评论(0) 推荐(0) 编辑

miRNA几大常用的数据库

摘要： 1.miRbasehttp://www.mirbase.org/2.miRDBhttp://www.mirdb.org/miRDB/policy.html3.miRandahttp://www.microrna.org/microrna/home.do4.TargetScanhttp://www.t 阅读全文

posted @ 2017-02-13 13:41 nkwy2012 阅读(14353) 评论(0) 推荐(0) 编辑

Linux command line exercises for NGS data processing

摘要： by Umer Zeeshan Ijaz The purpose of this tutorial is to introduce students to the frequently used tools for NGS analysis as well as giving experience 阅读全文

posted @ 2017-02-13 13:32 nkwy2012 阅读(1145) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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