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Peptide Sequence Databases蛋白序列的数据库 nrAll non-redundant GenBank CDS translations + RefSeq Proteins + PDB + SwissProt + PIR + PRF所有非冗余的的GenBank CDS区的翻译序 阅读全文
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20170222 ANNOVAR简介 ANNOVAR是由王凯编写的一个注释软件，可以对SNP和indel进行注释，也可以进行变异的过滤筛选。 ANNOVAR能够利用最新的数据来分析各种基因组中的遗传变异。主要包含三种不同的注释方法，Gene-based Annotation（基于基因的注释）、Reg 阅读全文
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pprint – 美观打印 作用：美观打印数据结构 pprint 包含一个“美观打印机”，用于生成数据结构的一个美观视图。格式化工具会生成数据结构的一些表示，不仅可以由解释器正确地解析，而且便于人类阅读。输出尽可能放在一行上，分解为多行时则需要缩进。 以下实例用用到的data包含一下数据 data 阅读全文
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每个人一生中都会遇到一件事情，在事情出现之前不会关心，但是事情一旦来临就发现它极其重要，并且需要在很短的时间内做出重大决定，那就是给自己的新生宝宝起个名字。 因为要在孩子出生后两周内起个名字（需要办理出生证明了），估计很多人都像我一样，刚开始是很慌乱的，虽然感觉汉字非常的多随便找个字做名字都行，后来 阅读全文
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转载自http://www.zilhua.com 在本博客中，所有的软件安装都在服务器上，且无root权限。理论上适合所有的用户。 我的安装目录 cd /home/zilhua/software 1、在官方网站下载新版本的源码包： http://www.perl.org/get.html，版本自己选 阅读全文
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转载自http://www.zilhua.com 在本博客中，所有的软件安装都在服务器上，且无root权限。理论上适合所有的用户。 我的安装目录 cd /home/zilhua/software 1、在官方网站下载新版本的源码包： http://www.perl.org/get.html，版本自己选 阅读全文
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1、 http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=1469385&do=blog&classid=166694&view=me&from=space [转载]如何使用SnpEff 对SNP结果进行分析 [转载]基因组变异检测概述 ：重要要看看 [ 阅读全文
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http://blog.163.com/bioinfor_cnu/blog/static/19446223720118205527863/ 所有文章：http://blog.163.com/bioinfor_cnu/blog/#m=0 1. 成对HMM用于双序列比对的基本思想： 2. 状态转移矩阵： 阅读全文
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1) 文件内全部替换： :%s#abc#123#g (如文件内有#，可用/替换,:%s/abc/123/g) --注：把abc替换成123 (或者: %s/str1/str2/g 用str2替换文件中所有的str1） 2) 文件内局部替换： :20,30s#abc#123(如文件内有#，可用/替换, 阅读全文
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http://blog.sina.com.cn/s/blog_72208a6a0101cdt1.html http://www.docin.com/p-350677620.html http://wenku.baidu.com/view/9bd89b7e31b765ce050814d5.html 在 阅读全文