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摘要: 下面用实例来说明这两个函数的作用: 这是一个数据框final: gene hsap mmul mmus rnor cfam 1 ENSG00000208234 0 NA NA NA NA 2 ENSG00000199674 0 2 2 2 2 3 ENSG00000221622 0 NA NA NA 阅读全文
posted @ 2017-09-05 15:39 nkwy2012 阅读(1685) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 1、综述 越来越多的R包正在由世界上不同的人所创建,其中一部分原因是devtools包使得开发R包1变得更加简单。devtools包不仅让开发R包变得简单,而且用于分发R包。 当开发者发布一个R包的时候,CRAN2一般是最常用的。使用install.packages()函数可以安装发布在CRAN上的 阅读全文
posted @ 2017-08-25 11:45 nkwy2012 阅读(3316) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: http://www.genowis.com/index.php?c=index&a=lists&catid=164 看着挺厉害 阅读全文
posted @ 2017-08-24 17:29 nkwy2012 阅读(147) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 1.先根据你的蛋白序列,输入到http://mcl1.ncifcrf.gov/dnaworks/,选择相应的物种,就可以自动给出该物种的优化序列。参考下面的这篇文章:DNAWorks: an automated method for designing oligonucleotides for PC 阅读全文
posted @ 2017-08-24 09:18 nkwy2012 阅读(7817) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 我们在做数据分析的时候,对数据进行操作也是一项极其重要的内容,这里我们同样介绍强大包reshape2,其中的几个函数,对数据进行操作cast和melt两个函数绝对少不了。 首先是cast,把长型数据转换成你想要的任何宽型数据, dcast(data, formula, fun.aggregate = 阅读全文
posted @ 2017-08-23 14:51 nkwy2012 阅读(313) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: rsync -av --include="*.fastq.gz" --include="*.fq.gz" --include="*/" --exclude=* /public/data ./ rsync用于Linux系统之间的文件同步,效果还是非常好的!故做个记录,以备参考! 一、rsync简介用于 阅读全文
posted @ 2017-08-16 14:20 nkwy2012 阅读(272) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 尽管R是一门以数值向量和矩阵为核心的统计语言,但字符串有时候也会在数据分析中占到相当大的份量。 R语言是一个擅长处理数据的语言,但是也不可避免的需要处理一些字符串(文本数据)。如何高效地处理文本数据,将看似杂乱无章的数据整理成可以进行统计分析的规则数据,是『数据玩家』必备的一项重要技能。 在编程语言 阅读全文
posted @ 2017-08-15 20:22 nkwy2012 阅读(657) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: R中的grep、grepl、sub、gsub、regexpr、gregexpr等函数都使用正则表达式的规则进行匹配。默认是egrep的规则,也可以选用Perl语言的规则。在这里,我们以R中的sub函数为例(因为该函数可以返回替换字符串后的具体内容)介绍正则表达式的用法。 对该函数的逻辑参数都使用默认 阅读全文
posted @ 2017-08-15 20:18 nkwy2012 阅读(3070) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 使用Git远程获取代码 [plain] view plain copy print? git clone https://github.com/twlkyao/findfile.git [plain] view plain copy print? [plain] view plain copy pr 阅读全文
posted @ 2017-08-07 15:41 nkwy2012 阅读(663) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 一、查看Linux内核版本命令(两种方法): 1、cat /proc/version [root@S-CentOS home]# cat /proc/versionLinux version 2.6.32-431.el6.x86_64 (mockbuild@c6b8.bsys.dev.centos. 阅读全文
posted @ 2017-08-07 15:01 nkwy2012 阅读(212) 评论(0) 推荐(0) 编辑
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