摘要：
今天介绍一些运算函数，它们的使用很简单，没有什么难度，但是也会用的着。 在医学统计学或者流行病学里的现场调查、样本选择经常会提到一个词：随机抽样。随机抽样是为了保证各比较组之间均衡性的一个很重要的方法。那么今天介绍的第一个函数就是用于抽样的函数sample： > x=1:10 > sample(x= 阅读全文
摘要：
R的包（package）通常有两种：1 binary package：这种包属于即得即用型（ready-to-use），但是依赖与平台，即Win和Linux平台下不同。2 Source package: 此类包可以跨平台使用，但用之前需要处理或者编译（compiled）。.libPaths()：查看 阅读全文
摘要：
linux 下用find命令查找文件，rm命令删除文件。 删除指定目录下指定文件find 要查找的目录名 -name .svn |xargs rm -rf 删除指定名称的文件或文件夹: find -type d | grep .svn$ | xargs rm -r 分析：find -type d | 阅读全文
摘要：
http://bioconductor.org/packages/devel/bioc/vignettes/metagenomeFeatures/inst/doc/Example_16S_Annotation_Workflow.html 阅读全文
摘要：
摘自 方匡南 等编著《R数据分析-方法与案例详解》.电子工业出版社R包简介R包提供了一个加载所需代码、数据和文件的集合。R软件自身就包含大约30种不同功能的包，这些基本包提供了R软件的基本功能。与此同时，R作为一个开源软件，它提供了各种统计计算函数，从而方便使用者能够灵活机动的进行数据分析，甚至创造 阅读全文
摘要：
https://www.zhihu.com/question/24501195 节选： 看了这么多答案，觉得 Hadley Wickhamhad.co.nz 在R使用者的地位好高啊。其实我也觉得Hadley的每个包都很好用，尤其是CRAN - Package plyr（他写的包中，这个接触得比较晚， 阅读全文
摘要：
在用R语言做各种事物时，用户自定义函数是不可或缺的。这期来讲讲如何自定义R的function。首先要介绍的是function的基本框架： 1 2 3 4 函数名称为myfunction arg1，arg2 为参数 statements 为函数语句 return(object)返回结果 两个例子 例子 阅读全文
摘要：
我们趋势分析的方法，其实参照一款非常有名软件STEM（Short Time-series Expression Miner，下载地址：http://www.sb.cs.cmu.edu/stem/）。这个软件的主要用途就是针对时间顺序取样的表达量数据进行聚类，分析其表达模式。如果你使用我们的趋势分析工 阅读全文
摘要：
http://blog.sciencenet.cn/blog-2985160-948631.html 我们在做人类全基因组分析的时候，经常需要找出基因组中所有基因的转录起始位点（Transcription Start Site, TSS），利用R/Bioconductor很容易做到。 用到一个包 H 阅读全文