摘要：
OMICtools可谓是组学研究的航空母舰，其收集了基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等分析研究常用的4400余个工具和数据库。它允许用户submit自己的工具/数据库，每一个上传的工具/数据库都按照用途进行了分类，有相应的描述和链接，并且可以对这些工具/数据库作出评价，以利于他人借鉴和使用。 阅读全文
摘要：
有时候因为某些原因我们需要查看文件的MD5值，在Linux下这个就非常简单，只需要用md5sum命令即可，但是在Windows上却不知道对应的命令。今天就在网上查了一些，果然其实Windows也有对应的命令。而且该命令还可以查看SHA1值和SHA256值的功能。命令如下： certutil -has 阅读全文
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find ./ -name file_name.txt | xargs cat >> file_name.txt 阅读全文
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install.packages('devtools')library(devtools)install_github('hdng/clonevol') Installation failed: Timeout was reached install_github('hdng/clonevol', 阅读全文
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1.>c-Bioportal: www.cbioportal.org 整合和简化了包括TCGA，ICGC以及GEO等多个癌症基因组数据库的内容，提供友好可视化的界面，可供下载。 主要展示基因的somatic 突变谱，拷贝数变化，mRNA&miRNA表达量变化，DNA甲基化以及蛋白质表达的情况，并结合 阅读全文
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在R中，和排序相关的函数主要有三个：sort()，rank()，order()。 sort(x)是对向量x进行排序，返回值排序后的数值向量。rank()是求秩的函数，它的返回值是这个向量中对应元素的“排名”。而order()的返回值是对应“排名”的元素所在向量中的位置。 下面以一小段R代码来举例说明 阅读全文
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凡是和数据无关的图形设置内容理论上都可以归为主题类，但考虑到一些内容（如坐标轴）的特殊性，可以允许例外的情况。主题的设置相当繁琐，很容易就占用了 大量的作图时间，应尽量把这些东西简化，把注意力主要放在数据分析上。基于这种考虑，ggplot2主题设置的内容虽然相当多，本文仅在总体上作一简单介 绍。 1 阅读全文
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melt()函数melt为熔化、溶解的意思，此处可理解为扔进去一个东西，出来另外一个本质一样但形状不一样的东西。语法结构：melt(data, ..., na.rm = FALSE, value.name = "value")其中：data可以是数据框、数组或列表，melt()函数会根据数据类型选择 阅读全文
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今天查了一下R语言中set.seed()，该命令的作用是设定生成随机数的种子，种子是为了让结果具有重复性。如果不设定种子，生成的随机数无法重现。 set.seed()用于设定随机数种子，一个特定的种子可以产生一个特定的伪随机序列，这个函数的主要目的，是让你的模拟能够可重复出现，因为很多时候我们需要取 阅读全文