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2017年12月28日
肿瘤转录组数分析CRN:Cancer RNA-Seq Nexus
摘要: http://syslab4.nchu.edu.tw/index.jsp
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posted @ 2017-12-28 16:46 nkwy2012
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TCGA系列--生存分析oncolnc
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posted @ 2017-12-28 16:34 nkwy2012
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TCGA系列--miRNA数据分析
摘要: http://mirgator.kobic.re.kr/help.html
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posted @ 2017-12-28 16:32 nkwy2012
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TCGA系列--甲基化神器mexpress
摘要: http://mexpress.be/
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posted @ 2017-12-28 16:31 nkwy2012
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2017年12月26日
R语言的plyr包简介--转载
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posted @ 2017-12-26 22:42 nkwy2012
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R:reshape2包中的melt
摘要: melt()函数melt为熔化、溶解的意思,此处可理解为扔进去一个东西,出来另外一个本质一样但形状不一样的东西。语法结构:melt(data, ..., na.rm = FALSE, value.name = "value")其中:data可以是数据框、数组或列表,melt()函数会根据数据类型选择
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posted @ 2017-12-26 22:26 nkwy2012
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TCGA系列--GDCRNATools
摘要: https://github.com/Jialab-UCR/GDCRNATools GDCRNATools - An R package for downloading, organizing, and integrative analyzing lncRNA, mRNA, and miRNA da
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posted @ 2017-12-26 15:19 nkwy2012
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2017年12月23日
R软件中排序:sort(),rank(),order()
摘要: 在R中,和排序相关的函数主要有三个:sort(),rank(),order()。 sort(x)是对向量x进行排序,返回值排序后的数值向量。rank()是求秩的函数,它的返回值是这个向量中对应元素的“排名”。而order()的返回值是对应“排名”的元素所在向量中的位置。 下面以一小段R代码来举例说明
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posted @ 2017-12-23 11:00 nkwy2012
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R中利用apply、tapply、lapply、sapply、mapply、table等函数进行分组统计--转载
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posted @ 2017-12-23 10:35 nkwy2012
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2017年12月22日
TCGA系列--TCGA长链非编码RNA的可视化工具TANRIC
摘要: http://ibl.mdanderson.org/tanric/_design/basic/index.html
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posted @ 2017-12-22 15:27 nkwy2012
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