12 2017 档案
摘要：阅读目录 1.概述 2.diff如何工作，如何理解diff的执行结果 3.Normal模式 4.Context模式 5.Unified模式 6.比较目录 7.一些有用的参数 阅读目录 1.概述 2.diff如何工作，如何理解diff的执行结果 3.Normal模式 4.Context模式 5.Uni
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摘要：Seker: find . -name "*" |xargs cp ????这里 xargs cp 怎么区分cp源 和 cp目的 例如：想把 查询到的文件 都copy到/home/users/中去 find . -name "*" | xargs cp /home/users/cp命令在这里就变成:
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摘要：http://syslab4.nchu.edu.tw/index.jsp
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摘要：http://mirgator.kobic.re.kr/help.html
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摘要：http://mexpress.be/
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摘要：melt()函数melt为熔化、溶解的意思，此处可理解为扔进去一个东西，出来另外一个本质一样但形状不一样的东西。语法结构：melt(data, ..., na.rm = FALSE, value.name = "value")其中：data可以是数据框、数组或列表，melt()函数会根据数据类型选择
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摘要：https://github.com/Jialab-UCR/GDCRNATools GDCRNATools - An R package for downloading, organizing, and integrative analyzing lncRNA, mRNA, and miRNA da
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摘要：在R中，和排序相关的函数主要有三个：sort()，rank()，order()。 sort(x)是对向量x进行排序，返回值排序后的数值向量。rank()是求秩的函数，它的返回值是这个向量中对应元素的“排名”。而order()的返回值是对应“排名”的元素所在向量中的位置。 下面以一小段R代码来举例说明
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摘要：http://ibl.mdanderson.org/tanric/_design/basic/index.html
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摘要：中国大牛力作 张泽民： http://gepia.cancer-pku.cn/index.html http://cancer-pku.cn/
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摘要：http://griffithlab.org/
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摘要：R语言常用的去重命令有unique duplicated unique主要是返回一个把重复元素或行给删除的向量、数据框或数组 > x <- c(3:5, 11:8, 8 + 0:5)> x [1] 3 4 5 11 10 9 8 8 9 10 11 12 13> unique(x)[1] 3 4 5
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摘要：https://www.genenames.org/
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摘要：肿瘤的发生与免疫系统的功能密切相关。在免疫系统中，MHC(主要组织相容性复体,majorhistocompatibilitycomplex)是所有生物相容复合体抗原的一种统称。HLA(humanleucocyteantigen)就是人类的MHC基因，即人类白细胞抗原，位于6号染色体，它所在的区域是人
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摘要：肿瘤免疫治疗，实际上分为两大类。一种把肿瘤的特征“告诉”免疫细胞，让它们去定位，并造成杀伤；另一种是解除肿瘤对免疫的耐受/屏蔽作用，让免疫细胞重新认识肿瘤细胞，对肿瘤产生攻击(一般来说，肿瘤细胞会巧妙伪装，逃脱免疫的监视)。第一种情况，因为要利用机体自身的免疫细胞，因此，目前多为免疫细胞治疗；后一种
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摘要：近几年，免疫疗法的成功使癌症治疗进入了新的时代。无论是科研界，还是商业界，都丝毫没有掩饰对这一领域的热情。2016年，Cell杂志公布的年度十大最佳论文中，免疫疗法占两席。事实上，这两项成果只是去年癌症免疫疗法重要突破进展中的“冰山一角”。 刚刚过去的2016年，科学家们在Cell、Nature、S
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摘要：软件的路径设置对于电脑的内存管理和自己的寻根究底十分重要。所以，合理的设置R中相关路径，能更加方便快捷的管理自己的相关文件，提高学习R语言的效率，建立自己的习惯体系。 R中的路径设置主要有以下几个方面： 工作目录的路径 安装包的路径 关于工作目录 1.使用getwd()函数来显示当前工作目录。 1
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摘要：http://bioconductor.org/packages/devel/bioc/vignettes/TCGAbiolinks/inst/doc/tcgaBiolinks.html#gdcquery:_searching_tcga_open-access_data 举例： Working wi
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摘要：不管别人怎么说，反正我是非常喜欢perl语言的！ 也会继续学习，以前写过不少perl模块的博客，发现有点乱，正好最近看到了关于local::lib这个模块。 居然是用来解决没有root权限的用户安装，perl模块问题的！ 首先说一下，如果是root用户，模块其实没有问题，直接用cpan下载器，几乎能
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摘要：现在做生物和医学的，很多都可能会和各种组学数据打交道。其中表达谱数据总是最常用的，也是比较好测的。即使在工作中不去测序，也可以利用已有的数据库去做一些数据挖掘，找一找不同表型（比如癌症）对应的marker或者调控的通路。这里跟大家推荐一款分析表达谱数据的神器GENE-E，亲测比较好用，满足常用需求，
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摘要：转载：http://www.bio-info-trainee.com/1327.html 收集了那么多的癌症细胞系的表达数据，拷贝数变异数据，突变数据，总不能放着让它发霉吧! 这些数据可以利用的地方非常多，但是在谷歌里面搜索引用了它的文章却不多，我挑了其中几个，解读了一下别人是如何利用这个数据的，当
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摘要：自2015年1月20日美国总统奥巴马高调宣布启动“精准医疗计划（Precision Medicine Initiative）”以来，全球范围内掀起一股精准医疗热。在国内，精准医疗也风生水起，受到业内学者、药企代表、患者等相关人群的广泛关注。精准医疗本质上是一种更为精确的个性化医疗，非常适用于恶性肿瘤
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摘要：进入2017年，当红辣子鸡PD-1疗法，一路横扫多个适应症。而CAR-T治疗的“小车”在获得FDA专委会推荐后也已经走上高速路，成为免疫治疗又一里程碑事件。PD-1、CAR-T之后，下一个免疫治疗产品又将花落谁家？ 7月初，Nature同期发表2项临床试验结果，突然引爆个性化肿瘤疫苗热点，新技术是横
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