摘要: http://www.cogonline.com/Article/zyyd/yjsj/144070515.html Desheng Liang,* Ying Peng,* Weigang Lv,* Linbei Deng,* Yanghui Zhang,* Haoxian Li,* Pu Yang, 阅读全文
posted @ 2017-03-16 17:31 nkwy2012 阅读(9082) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: pysam 模块介绍!!!! http://pysam.readthedocs.io/en/latest/index.html 在开发基因组相关流程或工具时,经常需要读取、处理和创建bam、vcf、bcf文件。目前已经有一些主流的处理此类格式文件的工具,如samtools、picard、vcftoo 阅读全文
posted @ 2017-03-16 10:19 nkwy2012 阅读(3537) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: https://www.biostars.org/p/8318/ I want to have an estimate of how many reads in a SAM file are mapped to the reference I'm using. I used samtools vie 阅读全文
posted @ 2017-03-16 09:30 nkwy2012 阅读(563) 评论(0) 推荐(0) 编辑