11 2016 档案
摘要：把下列所有.c的文件名修改为.cc rename .c .cc *.c
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摘要：命令参数： -m, --mode=模式，设定权限<模式> (类似 chmod)，而不是 rwxrwxrwx 减 umask -p, --parents 可以是一个路径名称。此时若路径中的某些目录尚不存在,加上此选项后,系统将自动建立好那些尚不存在的目录,即一次可以建立多个目录; -v, --verb
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摘要：http://www.molecularevolution.org/resources/activities/QC_of_NGS_data_activity_new table of contents expected learning outcomes getting started exerci
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摘要：python -m pip install --trusted-host pypi.python.org
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摘要：sratoolkit.2.6.2-centos_linux64/bin/prefetch 下载SRA文件 fastq-dump --split-3 SRR2923014.sra 转成fq文件
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摘要：一、ConfigParser简介 ConfigParser 是用来读取配置文件的包。配置文件的格式如下：中括号“[ ]”内包含的为section。section 下面为类似于key-value 的配置内容。 1: [db] 2: db_host = 127.0.0.1 3: db_port = 22
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摘要：在python下，获取当前执行主脚本的方法有两个：sys.argv[0]和__file__。 sys.argv[0] 获取主执行文件路径的最佳方法是用sys.argv[0]，它可能是一个相对路径，所以再取一下abspath是保险的做法，像这样： import os,sys dirname, file
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摘要：http://www.cravat.us/CRAVAT/
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摘要：第一代无创产前诊断是通过染色体倍数异常来判断的，最典型的就是先抽取孕妇的外周血，提取游离DNA，通过高通量测序技术分析每染色体片段，判断胎儿是否是21号三倍体。第二代无创产前诊断分析的是基因突变诊断。 最新这篇文章通过针对母体血浆DNA进行全基因组测序（195×和270×单倍体基因组覆盖），探索无创
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摘要：锐羿基因： http://www.realbio.cn/index.php?c=list&cs=keyandongtai& 科研动态更新及时 青岛过程能源所： http://www.computationalbioenergy.org/software.html
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摘要：sys 模块提供了许多函数和变量来处理 Python 运行时环境的不同部分. 处理命令行参数 在解释器启动后, argv 列表包含了传递给脚本的所有参数, 列表的第一个元素为脚本自身的名称. 使用sys模块获得脚本的参数 复制代码代码如下: print "script name is", sys.a
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摘要：在写脚本处理文件系统时，经常需要加载很多模块。其中好多有用函数分散在各种不同的模块中。它们有些是Perl的内置函数，有些是在同Perl一起发行的标准模块中，另外一些是通过CPAN安装的。 下面来看15个最常用的工具。 在写脚本处理文件系统时，经常需要加载很多模块。其中好多有用函数分散在各种不同的模块
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摘要：python 中的is、==和cmp()，比较字符串 经常写 shell 脚本知道，字符串判断可以用 =，!= 数字的判断是 -eq，-ne 等，但是 Python 确不是这样子地。所以作为慢慢要转换到用 Python 写脚本，这些基本的东西必须要掌握到骨子里！ 在 Python 中比较字符串最好是
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摘要：一、计算文件的行数 最简单的办法是把文件读入一个大的列表中,然后统计列表的长度.如果文件的路径是以参数的形式filepath传递的,那么只用一行代码就可以完成我们的需求了:count = len(open(filepath,'rU').readlines()) 如果是非常大的文件,上面的方法可能很慢
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摘要：Python编程时，经常需要跳过第一行读取文件内容。比较容易想到是为每行设置一个line_num，然后判断line_num是否为1，如果不等于1，则进行读取操作。相应的Python代码如下： [python] view plain copy input_file = open("C:\\Python
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摘要：1. Pod 语法 pod中用段分可以分为三种，普通段落，字面段落（Verbatim Paragraph）和命令段落。三者的区分非常简单，以=pod|head1|cut|over等指示字开始的段落为命令段落，以空格或制表符（\t）等缩进开始的段落为字面段落，其余的就是普通段落。 [php] view
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摘要：perl的map函数的使用： 语法 map EXPR, LIST map BLOCK LIST 定义和使用 对list中的每个元素执行EXPR或BLOCK，返回新的list。对每一此迭代，$_中保存了当前迭代的元素的值。 返回值 如果返回值存储在scalar标量中，则代表map()返回数组的元素个数
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