pybedtools --bedtools的python包

http://daler.github.io/pybedtools/

 

用个下面这个

>>> fn = pybedtools.example_filename('test.fa')

>>> BedTool.seq('chr1:2-10', fn)

'GATGAGTCT'

>>> BedTool.seq(('chr1', 1, 10), fn)

'GATGAGTCT'

posted @ 2017-05-04 15:42  nkwy2012  阅读(1157)  评论(0)  编辑  收藏  举报