随笔分类 -  GATK

mutect/mutsig/gistic官网汇总
摘要：http://software.broadinstitute.org/software/cprg/ 阅读全文
posted @ 2018-07-12 09:08 nkwy2012 阅读(465) 评论(0) 推荐(0) 编辑
一文搞懂HMM（隐马尔可夫模型）--转载
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posted @ 2017-06-15 08:59 nkwy2012 阅读(11) 评论(0) 推荐(0) 编辑
GATK 一些资料
摘要：1、 http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=1469385&do=blog&classid=166694&view=me&from=space [转载]如何使用SnpEff 对SNP结果进行分析 [转载]基因组变异检测概述 ：重要要看看 [ 阅读全文
posted @ 2017-02-19 18:57 nkwy2012 阅读(236) 评论(0) 推荐(0) 编辑
GATK--使用转载
摘要：http://blog.sciencenet.cn/blog-1469385-819498.html 文章目录 一.准备工作 二.流程概览 三.流程 首先说说GATK可以做什么。它主要用于从sequencing 数据中进行variant calling，包括SNP、INDEL。比如现在风行的exom 阅读全文
posted @ 2017-01-20 14:29 nkwy2012 阅读(12492) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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