随笔分类 - MetaGenome
摘要：转载：https://mp.weixin.qq.com/s/xsL9GuLs7b3nRF8VeRtinQ 建立在高通量测序基础上的微生物群落研究，当前主要有三大类：基于16S/18S/ITS等扩增子做物种分类的Metataxanomics、鸟枪法打断全基因组DNA序列的Metagenomics和基于
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摘要：摘 要： 多位点序列分型（MLST）是一种基于核酸序列测定的细菌分型方法，通过PCR扩增多个管家基因内部片段，测定其序列，分析菌株的变异，从而进行分型。MLST被广泛应用于病原菌、环境菌和真核生物中。与传统分子生物学分型方法相比，MLST操作简单，具有更高的分辨力，能将同种细菌分为更多的亚型，并确定
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摘要：随着抗生素药物的发现及使用，越来越多的耐药菌株由此产生。而耐药菌株的发展则会增加疾病治疗的难度和成本，因此耐药微生物的研究则显得尤为重要。目前，通过对耐药基因的鉴定挖掘能够一定程度上帮助我们揭开耐药机制，为疾病的治疗、药物研发提供参考。ARDB是最先整合了各种微生物中抗药基因的数据库，但它从2009
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摘要：微生物生态（MicrobialEcology），又名环境微生物（Environmental Microbiology），是研究微生物之间及其与环境之间相互关系的学科。从生物角度，其研究对象主要有真核微生物（Eukaryotes，如原生生物、真菌等）、原核微生物（Prokaryotes，细菌和古菌）和
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摘要：sliva rRNA数据库（http://www.arb-silva.de/）用来检查和比对RNA序列，既可以针对16S/18S,SSU，也可以针对23S/28S, LSU，包括了Bacteria, Archaea and Eukarya。同时也是ARB的官方指定数据库。 LSU: Large su
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摘要：锐羿基因： http://www.realbio.cn/index.php?c=list&cs=keyandongtai& 科研动态更新及时 青岛过程能源所： http://www.computationalbioenergy.org/software.html
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