随笔分类 - python
摘要:yaml语法 格式 它的基本语法规则如下 大小写敏感 使用缩进表示层级关系 缩进时不允许使用Tab键,只允许使用空格。 缩进的空格数目不重要,只要相同层级的元素左侧对齐即可 YAML 支持的数据结构有三种 1、对象:键值对的集合,又称为映射(mapping)/ 哈希(hashes) / 字典(dic
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摘要:vcf文件的全称是variant call file,即突变识别文件,它是基因组工作流程中产生的一种文件,保存的是基因组上的突变信息。通过对vcf文件进行分析,可以得到个体的变异信息。嗯,总之,这是很重要的文件,所以怎么处理它也显得十分重要。它的文件信息如下: 文件的开头是一堆以“##”开始的注释行
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摘要:SMTP是发送邮件的协议,Python内置对SMTP的支持,可以发送纯文本邮件、HTML邮件以及带附件的邮件。 Python对SMTP支持有smtplib和email两个模块,email负责构造邮件,smtplib负责发送邮件。 首先,我们来构造一个最简单的纯文本邮件: 注意到构造MIMEText对
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摘要:SMTP(Simple Mail Transfer Protocol)即简单邮件传输协议,它是一组用于由源地址到目的地址传送邮件的规则,由它来控制信件的中转方式。 python的smtplib提供了一种很方便的途径发送电子邮件。它对smtp协议进行了简单的封装。 Python创建 SMTP 对象语法
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摘要:最近看到好几次群里有人问xlwt、wlrd的问题,怎么说呢,如果是office2007刚出来,大家用xlsx文件用不习惯,还可以理解,这都10年过去了喂,就算没有进化到office2016,还在用office2003的有点说不过去吧。有人可以用xlsx保存为xls啊!——故意多做几步操作,目的呢?为
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摘要:snakemake是一个用来编写任务流程的工具,用python编写的,因此其执行的流程脚本也比较通俗易懂,易于理解。 一、从一个简单的例子开始 1、安装snakemake 安装snakemake的方法有多种,snakemake官方推荐的是conda,安装方法如下: conda install -c
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摘要:import time,sys def view_bar(num, total): rate = float(num) / float(total) rate_num = int(rate * 100) r = '\r%s %d%%'%('>'*rate_num,rate_num) sys.stdo
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摘要:https://blog.csdn.net/lis_12/article/details/54618868 Python 详解命令行解析 - argparse Python 详解命令行解析 - argparse sys.argv why choice argparse ? 创建解析器 - Argum
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摘要:https://blog.csdn.net/gqtcgq/article/details/49255995 Distutils可以用来在Python环境中构建和安装额外的模块。新的模块可以是纯Python的,也可以是用C/C++写的扩展模块,或者可以是Python包,包中包含了由C和Python编写
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摘要:conda的确是一个非常好的工具,对于初学者而言,安装软件就跟用XXX软件管理器一样方便。正因为他如此便利,以至于我介绍如何手动安装工具时,总有人问我为啥不用conda。 我用conda,并且用的很好。 下面解决一个非常有趣的conda安装工具后出现的动态库缺失的问题。这是我最近遇到的例子, $ s
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摘要:Python3 被越来越多的开发者所接受,同时让人尴尬的是很多遗留的老系统依旧运行在 Python2 的环境中,因此有时你不得不同时在两个版本中进行开发,调试。 如何在系统中同时共存 Python2 和 Python3 是开发者不得不面对的问题,一个利好的消息是,Anaconda 能完美解决Pyth
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摘要:CSV(comma-separated values) 是跨多种形式导入导出数据的标准格式,比如 MySQL、Excel。 它以纯文本存储数和文本。文件的每一行就代表一条数据,每条记录包含了由逗号分隔的一个或多个属性值。这个标准格式的名字来源就是每条记录是用逗号将其属性分隔的。 即使有这个非常明显的
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摘要:http://www.cuijiahua.com/resource.html 曾看过的书,感觉一些很有用的学习资料,推荐给大家! Python基础: 网络教程推荐: 教程地址:点击查看 2. 系统学完也不一定记得很清楚,这时我们需要一个快速的查询手册,菜鸟教程是一个不错的选择: 教程地址:点击查看
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摘要:1、https://github.com/mskcc/vcf2maf 2、https://github.com/cbare/vcf2maf
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摘要:MyGene.Info provides simple-to-use REST web services to query/retrieve gene annotation data. It’s designed with simplicity and performance emphasized.
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摘要:作者简介: Matthew Mayo 翻译:王鹏宇 开始。这是最容易令人丧失斗志的两个字。迈出第一步通常最艰难。当可以选择的方向太多时,就更让人两腿发软了。 从哪里开始? 本文旨在通过七个步骤,使用全部免费的线上资料,帮助新人获取最基本的 Python 机器学习知识,直至成为博学的机器学习实践者。这
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