2017年5月22日
Python os.path模块
摘要： 1、os.path.splitext(path) #返回一个元祖（路经，扩展名） 例如： 而os.path.split（path) 是返回(路经，文件名.扩张名) 2、os.path.dirname(path) 返回文件路经的目录，也就是os.path.split（path)第一个元素，如： 3、o 阅读全文
posted @ 2017-05-22 18:16 Bio-Liu 阅读(173) 评论(0) 推荐(0) 编辑
把文件内容按照染色体分开写出
摘要： 测试序列如下，text.txt: chr2 43995310 43995986 chr17 49788603 49789067 chr17 59565573 59566163 chr19 8390308 8390745 chr12 49188033 49189033 chr7 974903 9755 阅读全文
posted @ 2017-05-22 17:44 Bio-Liu 阅读(560) 评论(0) 推荐(0) 编辑
2017年5月17日
fasta文件中序列的排序
摘要： 同样的名为read_1.fa 的fasta文件，里面有若干序列，如： >@r1TGAATGCGAACTCCGGGACGCTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACNGTACGCTGAGGGCAGAAAAAATCGTCGGGGACATTNTAAAGGCGGCGAGCG 阅读全文
posted @ 2017-05-17 22:03 Bio-Liu 阅读(2879) 评论(0) 推荐(0) 编辑
Python 任意数量的关键字实参
摘要： 将函数编写成能够接受任意数量的键-值对——调用语句提供类多少就接受多少，直接看下面例子： 阅读全文
posted @ 2017-05-17 13:38 Bio-Liu 阅读(1025) 评论(0) 推荐(0) 编辑
2017年5月16日
strip()、rstrip()和lstrip()
摘要： 字符串的3种方法，可以删除字符串两边，右边和左边的空白字符，包括空格，制表符和换行符。 strip()方法可以返回一个新的字符串，去掉类原字符串左右两边的空白字符。rstrip()和lstrip() 同样返回新的字符串，分别去掉类字符串右边和左边的空白字符。看下面例子： 阅读全文
posted @ 2017-05-16 22:05 Bio-Liu 阅读(1689) 评论(0) 推荐(0) 编辑
2017年5月14日
Vim 中快速移动系列（1）
摘要： ^ 移动到实际行的第一个非空白字符 $ 移动到实际行的末尾 0 移动到实际行的行首 基于单词的移动： w和b都是以词首为目标， w 正向移动到下一单词的开头 b正向移动到当前单词或上一单词的开头 e 正向移动到当前单词或下一单词的结尾 w，b，e这些基于正向或反向的移动，比h和l一次移动一列快的多 阅读全文
posted @ 2017-05-14 22:24 Bio-Liu 阅读(1535) 评论(0) 推荐(0) 编辑
Python中的read(), readline(), readlines()
摘要： 文件对象提供了三个“读”方法： .read()、.readline() 和 .readlines()。 read() 每次读取整个文件，它通常用于将文件内容放到一个字符串变量中。然而 .read() 生成文件内容最直接的字符串表示，但对于连续的面向行的处理，它却是不必要的，并且如果文件大于可用内存， 阅读全文
posted @ 2017-05-14 22:11 Bio-Liu 阅读(236) 评论(0) 推荐(0) 编辑
Python 列表解析（列表生成式）
摘要： 列表解析也成列表生成式，是将for循环和创建新元素的代码合并成一行，并自动附加新元素，如下面例子： 要使用别表生成式，首先要定义一个列表名，如此处的squares，然后定义一个表达式，如此处的i**2，最后编写一个for循环，用于给表达式提供值。 完全用for循环替换的代码为： 阅读全文
posted @ 2017-05-14 11:05 Bio-Liu 阅读(1171) 评论(0) 推荐(0) 编辑
Python lambda 表达式介绍
摘要： 原文地址：http://www.cnblogs.com/evening/archive/2012/03/29/2423554.html 在学习python的过程中，lambda的语法时常会使人感到困惑，lambda是什么，为什么要使用lambda，是不是必须使用lambda？ 下面就上面的问题进行一 阅读全文
posted @ 2017-05-14 09:57 Bio-Liu 阅读(753) 评论(0) 推荐(0) 编辑
2017年5月13日
Python中sort()和sorted()的区别
摘要： 1、sort()是可变对象（字典）的方法，无参数，无返回值， sort（）会改变可变对象，因此无需返回值。例如： list: 即sort（）直接将可变对象的值给改变了。 或者： 2、sorted()是python的内置函数，并不是可变对象(列表、字典)的特有方法，sorted()函数需要一个参数(参 阅读全文
posted @ 2017-05-13 23:45 Bio-Liu 阅读(1939) 评论(0) 推荐(0) 编辑