QQplot

在GWAS（基因组关联研究）中，QQ plot（Quantile-Quantile plot，分位数-分位数图）是一种常用的统计图形，用于评估GWAS结果中的关联统计量是否偏离了预期的分布。

• x轴：预期的P值分布的分位数。通常是以负对数刻度表示（-log10(P)）。在QQ图上，x轴的数值范围从较小的P值开始（更显著）到较大的P值（较不显著）。

• y轴：观察到的P值的分位数。同样以负对数刻度表示（-log10(P)）。y轴的数值表示观察到的P值在整个数据集中的相对位置。

GWAS旨在寻找基因型和表型之间的关联，通过对大量的SNP（单核苷酸多态性）进行关联分析。在GWAS中，每个SNP都会计算一个关联统计量（例如p-value），用于衡量该SNP与表型之间的关联强度。QQ plot用于比较这些关联统计量的分布与预期的均匀分布（或者预期的对数线性分布）之间的差异。

 

如果GWAS结果符合预期的均匀分布（或对数线性分布），QQ plot上的点应该大致沿着对角线分布。

如果点集明显偏离对角线，那么可能存在显著关联的SNP，其关联统计量超出了预期的范围，暗示着可能存在真正的关联信号。