随笔分类 -  生物学 / 表达组

摘要：表达组（expression profile）是指在一个生物体或细胞中的所有基因在特定时间和条件下的表达情况的总和。表达组研究的主要目标是了解基因的表达模式，特别是哪些基因在不同条件下的表达水平发生了变化。 其实就是mRNA分子被细胞中的核糖体（ribosome）解读，根据mRNA上的核酸序列合成蛋 阅读全文

摘要：TASSEL（Trait Analysis by aSSociation, Evolution and Linkage）是一个用于遗传数据分析的开源软件套件。 TASSEL提供了一系列工具和算法，用于进行关联分析、群体结构分析、基因型-表型关联分析等。 TASSEL最初是由康奈尔大学开发的，旨在支持 阅读全文

摘要：TWAS（Transcriptome-Wide Association Study）全转录组关联分析 思想： 用于探索基因表达与复杂性状（如疾病风险）之间的关联。传统的GWAS（Genome-Wide Association Study）方法主要关注基因组中的遗传变异与疾病之间的关系，而TWAS则着 阅读全文

摘要：WGCNA（Weighted Gene Co-Expression Network Analysis）加权基因共表达网络分析 Gene：基因 Genome：基因组 思想： 将基因表达数据转化为基因共表达网络，其中每个基因是网络中的一个节点，而基因之间的共表达关系则用边连接。 WGCNA根据基因之间的 阅读全文