摘要：
bamkit 功能很简陋，后续有空再添加些其他功能，当然也可能没有后续了😁 install cargo install bamkit # or git clone https://github.com/sharkLoc/bamkit.git cd bamkit cargo b --release 阅读全文
摘要：
不一次性将数据读入内存，只遍历一次数据即可等概率抽取子集数据，真是神奇。 测试例子： 0到99一百个数字中随机抽取10个数，每个数被抽到概率1/10；重复1000次抽样，结果统计每个数字被抽到的次数为 1000 * 1/10 = 100 次左右。 use rand::Rng; use std::co 阅读全文
摘要：
断断续续的学了些rust语法，就想着写些简单的东西，以熟悉语法为主。这次主要针对fasta文件的简单处理写了fakit，参数也不多可以利用管道组合使用，主要是复杂的功能我不会，哈哈。 github： https://github.com/sharkLoc/fakit install git clon 阅读全文
摘要：
bamcov：一个基于命令行的可视化bam文件深度的工具。 软件采用C语言编写，下载附带测试数据，参数较少，使用方便。 github : https://github.com/fbreitwieser/bamcov install : git clone --recurse-submodules h 阅读全文
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大多数情况下3分钟就能有回应，https://www.ablesci.com/ 阅读全文
摘要：
这里是指数组作为hash的value，即一个key对应多个值 这里利用perl中的特殊句柄DATA做示例用以备忘{perl 数据结构一旦复杂点，可读性急剧下降，坑🕳}。 demo： use strict; use warnings; my %ha; while(<DATA>){ chomp; my 阅读全文
摘要：
一般在实验中样本存在多组值的时候，条形图通常都会加上误差棒，这里的画图脚本留作参考和备忘。 测试数据 sample A B C D E F yzx 587.38 184.66 236.97 5.28 0.44 1.76 yzx 123.52 189.88 145.47 1.53 1.53 0 yzx 阅读全文
摘要：
前面写了一个fastq文件统计结果的可视化小软件，https://www.cnblogs.com/mmtinfo/p/16428960.html，抽空把测序质量分布热图补上了。大概这个样子，丑了点，将就着看，质量值和位置对应的数据越多，颜色就越深。后面抽空把命令行参数加上，可以指定输出图片的名字，图 阅读全文
