摘要：
这里是指数组作为hash的value，即一个key对应多个值 这里利用perl中的特殊句柄DATA做示例用以备忘{perl 数据结构一旦复杂点，可读性急剧下降，坑🕳}。 demo： use strict; use warnings; my %ha; while(<DATA>){ chomp; my 阅读全文
摘要：
一般在实验中样本存在多组值的时候，条形图通常都会加上误差棒，这里的画图脚本留作参考和备忘。 测试数据 sample A B C D E F yzx 587.38 184.66 236.97 5.28 0.44 1.76 yzx 123.52 189.88 145.47 1.53 1.53 0 yzx 阅读全文
摘要：
前面写了一个fastq文件统计结果的可视化小软件，https://www.cnblogs.com/mmtinfo/p/16428960.html，抽空把测序质量分布热图补上了。大概这个样子，丑了点，将就着看，质量值和位置对应的数据越多，颜色就越深。后面抽空把命令行参数加上，可以指定输出图片的名字，图 阅读全文
摘要：
定义一个求数组种最大值的泛型函数fn<T>largest(list: &[T]), largest1: 瑕疵在传入的参数于只适用于实现了Copy特征的类型. largest2: 添加Clone约束，改进后没有了参数类型的限制，但Clone会有额外的性能开销，会在堆上重新分配内存。 largest3： 阅读全文
摘要：
同一时间泛型只能是同一种类型，否则就用多个泛型参数。结构体这里的泛型参数T和K，就表示不同的参数类型，当然T和K也可以是同一种类型。 #[derive(Debug)] struct Base<T,K> { x: T, y: T, z: K, } impl<T,K> Base<T,K> { fn ne 阅读全文
摘要：
很久没更新博客了，惭愧OTZ.废话不多说，交作业啦(ง •_•)ง，学了一点rust基础，写了一个可视化fastq文件的小工具。 1、安装 地址：https://github.com/sharkLoc/visual_fq ，因为是linux平台下的工具（ｗｉｎ下也是可以的嘛💪），预先安装依赖 。 阅读全文
摘要：
rust特征小示例 1 #[derive(Debug)] 2 pub struct User{ 3 pub name:String, 4 pub gender: bool, 5 pub age:u8, 6 } 7 // 特征（接口） 8 pub trait Cheat{ 9 fn new(name: 阅读全文
摘要： 
bam文件的第二列的flag值，代表了当前read比对到基因组序列的基本情况。flag值由2的0次方到2的11次方这11个数字组成，即1，2，4，8，16，32，64，128，256，512，1024，2048。每个数字表示的比对情况这里不赘述，当获得当前read的flag值时，如何拆解成flag最 阅读全文
bam文件的第二列的flag值，代表了当前read比对到基因组序列的基本情况。flag值由2的0次方到2的11次方这11个数字组成，即1，2，4，8，16，32，64，128，256，512，1024，2048。每个数字表示的比对情况这里不赘述，当获得当前read的flag值时，如何拆解成flag最 阅读全文
摘要：
这里就用perl自带的DATA句柄做示例。 1 #!/usr/bin/perl 2 use strict; 3 use warnings; 4 5 my %hash; 6 my @arr; 7 while(<DATA>){ 8 chomp; 9 my @line = split /\s+/,$_; 阅读全文