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摘要: 断断续续的学了些rust语法,就想着写些简单的东西,以熟悉语法为主。这次主要针对fasta文件的简单处理写了fakit,参数也不多可以利用管道组合使用,主要是复杂的功能我不会,哈哈。 github: https://github.com/sharkLoc/fakit install git clon 阅读全文
posted @ 2022-10-30 20:15 天使不设防 阅读(152) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: bamcov:一个基于命令行的可视化bam文件深度的工具。 软件采用C语言编写,下载附带测试数据,参数较少,使用方便。 github : https://github.com/fbreitwieser/bamcov install : git clone --recurse-submodules h 阅读全文
posted @ 2022-10-10 16:51 天使不设防 阅读(203) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 大多数情况下3分钟就能有回应,https://www.ablesci.com/ 阅读全文
posted @ 2022-09-19 10:29 天使不设防 阅读(40) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 这里是指数组作为hash的value,即一个key对应多个值 这里利用perl中的特殊句柄DATA做示例用以备忘{perl 数据结构一旦复杂点,可读性急剧下降,坑🕳}。 demo: use strict; use warnings; my %ha; while(<DATA>){ chomp; my 阅读全文
posted @ 2022-08-31 21:48 天使不设防 阅读(361) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 一般在实验中样本存在多组值的时候,条形图通常都会加上误差棒,这里的画图脚本留作参考和备忘。 测试数据 sample A B C D E F yzx 587.38 184.66 236.97 5.28 0.44 1.76 yzx 123.52 189.88 145.47 1.53 1.53 0 yzx 阅读全文
posted @ 2022-08-11 22:45 天使不设防 阅读(319) 评论(2) 推荐(0) 编辑
该文被密码保护。 阅读全文
posted @ 2022-07-12 21:06 天使不设防 阅读(8) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 前面写了一个fastq文件统计结果的可视化小软件,https://www.cnblogs.com/mmtinfo/p/16428960.html,抽空把测序质量分布热图补上了。大概这个样子,丑了点,将就着看,质量值和位置对应的数据越多,颜色就越深。后面抽空把命令行参数加上,可以指定输出图片的名字,图 阅读全文
posted @ 2022-07-09 22:06 天使不设防 阅读(22) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 定义一个求数组种最大值的泛型函数fn<T>largest(list: &[T]), largest1: 瑕疵在传入的参数于只适用于实现了Copy特征的类型. largest2: 添加Clone约束,改进后没有了参数类型的限制,但Clone会有额外的性能开销,会在堆上重新分配内存。 largest3: 阅读全文
posted @ 2022-07-06 22:18 天使不设防 阅读(42) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 同一时间泛型只能是同一种类型,否则就用多个泛型参数。结构体这里的泛型参数T和K,就表示不同的参数类型,当然T和K也可以是同一种类型。 #[derive(Debug)] struct Base<T,K> { x: T, y: T, z: K, } impl<T,K> Base<T,K> { fn ne 阅读全文
posted @ 2022-07-05 22:09 天使不设防 阅读(16) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 很久没更新博客了,惭愧OTZ.废话不多说,交作业啦(ง •_•)ง,学了一点rust基础,写了一个可视化fastq文件的小工具。 1、安装 地址:https://github.com/sharkLoc/visual_fq ,因为是linux平台下的工具(win下也是可以的嘛💪),预先安装依赖 。 阅读全文
posted @ 2022-06-30 23:01 天使不设防 阅读(167) 评论(0) 推荐(1) 编辑
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