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摘要: 数据来源: 从这篇博客中借用下,百度云网页端居然可以直接下载文件了,稀奇 数据已经分享在百度云:客户年消费数据 密码:lehv 该份数据中包含客户id和客户6种商品的年消费额,共有440个样本 分析过程: 用python和R做个简单的PCA分析,顺便比较下结果是不是一致 numpy计算结果: imp 阅读全文
posted @ 2023-10-18 20:57 天使不设防 阅读(49) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 一个用于处理fastq测序文件的命令行小工具,功能还在不断更新中,子命令也不多,支持gzip压缩文件的输入和输出(结果文件名以.gz结尾,结果会自动压缩)。 reop: https://github.com/sharkLoc/fqkit install: cargo install fqkit us 阅读全文
posted @ 2023-10-15 11:29 天使不设防 阅读(642) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 按照key和value升序、降序、自定义排序示例 use std::collections::HashMap; use std::cmp::Ordering; fn main() { let mut df = HashMap::new(); for x in 5..=12 { let k = for 阅读全文
posted @ 2023-10-11 15:53 天使不设防 阅读(278) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 多线程之间的通信和内存共享常见方式 use std::sync::mpsc; use std::thread; use std::sync::{Arc,Mutex}; struct User { name: String } fn main() { // Arc 通过共享内存 在线程间通信 数据不可 阅读全文
posted @ 2023-09-09 19:54 天使不设防 阅读(40) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: # Per-base per-nucleotide depth analysis 统计bam文件每个位置的测序深度、和各种碱基深度、还包括indel,支持多线程。 ### github: `https://github.com/sstadick/perbase.git` ### install: ` 阅读全文
posted @ 2023-09-07 15:24 天使不设防 阅读(43) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: [上一篇](https://www.cnblogs.com/mmtinfo/p/16842120.html)博文中写到出了这个小工具,现在更新到0.2.5了,新增了一些子命令。有seqtk,seqkit等好用的工具珠玉在前,还写这个主要是学习和熟悉rust这门语言的基础语法了,写出来自己玩儿咯。 # 阅读全文
posted @ 2023-09-06 20:27 天使不设防 阅读(33) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 在目录 C:\Users\用户名\AppData\Roaming下新建目录 pip,并在pip目录中新建文件pip.ini,文件内容为: ``` [global] index-url = https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple ``` 速度起飞…… 阅读全文
posted @ 2023-07-17 16:34 天使不设防 阅读(81) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: web url: https://earray.chem.agilent.com/suredesign/index.htm 登录后下载 ![image](https://img2023.cnblogs.com/blog/1870934/202307/1870934-20230710144054905 阅读全文
posted @ 2023-07-10 14:41 天使不设防 阅读(6) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: # 中国人群队列研究汇总 #### 女娲基因组(2020年) * 群体规模:2999人 * 数据类型:位点注释数据(hg38 含有糖尿病患者);数据未开放下载,按区域/位点/基因 可在线查询 * 资源:[女娲基因组资源 (ibp.ac.cn)](http://bigdata.ibp.ac.cn/Ny 阅读全文
posted @ 2023-06-16 16:17 天使不设防 阅读(136) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 在本地使用blastn做序列比对时,若序列长度太短,比如长度不足30bp,是不会有任何比对结果输出的,之前也遇到过这个问题。今天逛论坛看到了,解决办法是指定参数-task,执行网页blast模式,亲测可用。 eg : blastn -query test.fa -db db_blast -evalu 阅读全文
posted @ 2023-04-23 10:00 天使不设防 阅读(250) 评论(0) 推荐(0) 编辑
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