04 2023 档案

摘要:在本地使用blastn做序列比对时,若序列长度太短,比如长度不足30bp,是不会有任何比对结果输出的,之前也遇到过这个问题。今天逛论坛看到了,解决办法是指定参数-task,执行网页blast模式,亲测可用。 eg : blastn -query test.fa -db db_blast -evalu 阅读全文
posted @ 2023-04-23 10:00 天使不设防 阅读(246) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:datasets NCBI出品跨平台轻松批量从数据库中下载数据的命令行工具 指南: 工具处于快速更新迭代阶段,正逐步添加新功能,,参考网址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/datasets/docs/v1/how-tos/ 安装: curl -o datasets 'htt 阅读全文
posted @ 2023-04-19 10:50 天使不设防 阅读(311) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:秩和检验: 用于比较两组独立样本的中位数是否有明显差异。它不需要对数据的分布进行任何假设,适用于任何两组样本大小相等或不等、符合连续性变量的情况。 在进行 Mann-Whitney U 检验时,需要根据研究问题确定备择假设类型来选择使用双侧检验还是单侧检验。 如果没有明确的预测或假设关于哪个样本的中 阅读全文
posted @ 2023-04-12 14:03 天使不设防 阅读(491) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:python 卡方检验 from scipy.stats import chisquare # 卡方检验包 import numpy as np observed = np.array([120,80]) # 观测值:200 人中吃香菜的男生120,女生80 expected = np.array( 阅读全文
posted @ 2023-04-11 21:07 天使不设防 阅读(47) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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