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天使不设防
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07 2020 档案
GO 语言使用copy 拷贝切片的问题
摘要:使用copy,直接改变原片的值,而不是先创建一个副本。
阅读全文
posted @
2020-07-20 22:18
天使不设防
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天使不设防
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1. Re:利用plink软件基于LD信息过滤SNP
@在生信里挖啊挖 很久不做这一块儿了,看上面的解释,是的,R方越小丢弃位点越多...
--天使不设防
2. Re:利用plink软件基于LD信息过滤SNP
请问--indep-pairwise 500 50 0.5会比--indep-pairwise 500 50 0.2保留更多的位点吗?生成的Vcf文件是不是更大一些?
--在生信里挖啊挖
3. Re:bcftools 提取vcf(snp/indel)文件子集
bcftools view -S keep.list test.vcf >sub_indv.vcf ,这个命令提取子集不是很好,因为会把全miss的位点都提取出来,应该加一个筛选过滤条件,比如maf等...
--双皮奶蛋黄
4. Re:bcftools 提取vcf(snp/indel)文件子集
@我看这头发还剩多少 肯定不能乱啊,他是直接按照你的给的位点list来提取的,所以你给的位点list要是按照顺序排列的,你后面提取出来的vcf文件也是按照正常顺序的,所以你先按照sort -k1,1n...
--双皮奶蛋黄
5. Re:checking whether the C++ compiler supports the long long type... no
@生信好难 注释掉 .bashrc 文件里面conda的环境变量,eg: export PATH=/home/user/work/biotools/conda/miniconda3/bin:$PATH...
--天使不设防
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