摘要：
本文介绍了一个名为SeqBreed的Python工具，用于评估基因组预测在复杂情况下的表现。该工具可以模拟任何数量的由任意数量的因果位点决定的复杂表型，可实现了GBLUP、SSGBLUP、PBLUP等，并支持多种基因组预测方法和复杂染色体类型。作者使用了果蝇和四倍体马铃薯的数据集进行了测试，并展示了 阅读全文
摘要：
这是美国爱荷华州立大学工业工程系王立志老师联合同校老师发表的一篇文章。Front. Plant Sci.虽然影响因子不高（大家应该都知道偏应用的数量遗传学发表的期刊普遍不高），但本文的引用还是蛮高的，好像是年度最佳论文之一吧。 本文介绍了一种基于深度学习的框架，用于预测作物产量。该框架结合使用卷积神 阅读全文
摘要：
今天小编给大家推荐一本关于基因编辑的科普故事书。此书曾入选中信出版2022年度好书，豆瓣读书评分也高达8.7分，值得一阅。 此书作者沃尔特·艾萨克森（Walter Isaacson)是美国知名传记作家，杜兰大学历史学教授，《时代周刊》前主编，CNN前董事长兼首席执行官。其他畅销传记作品有《史蒂夫·乔 阅读全文
摘要：
通用集成多组学数据集包 MOFA2 包含一系列用于训练和分析多组因子分析 （MOFA） 的工具。MOFA是一种概率因子模型，旨在从可以包含多个组学层和/或样本组的数据集中识别变异的主轴。有关样品的其他时间或空间信息可以使用MEFISTO框架进行合并，该框架是MOFA2的一部分。下游分析功能可用于检查 阅读全文
摘要：
问题 群友发来一个问题，来自一篇文献中的图。 分析 这幅图很明显是一个对角矩阵的统计图形，用R中GGally包的ggpairs() 函数就可以快速绘制。 案例如下： library(GGally) head(tips) pm <- ggpairs(tips) pm 绘图 我将模拟一个数据绘制。 li 阅读全文
摘要：
《生物信息学》联合国内高校学者，紧密跟踪学科发展，提炼学科精华，编写完成。全书涵盖了生物信息学、系统生物学、合成生物学的相关内容，以及应用于第二代测序技术的相关软件和算法。第一、二、三版出版以来，越来越多的高校将其作为首选专业教材或选修教材。作为科学出版社普通高等教育“十四五”规划教材，第四版在修订 阅读全文
摘要：
推荐一本理论与实践相结合的作物育种教材——《作物育种理论与案例分析（第二版）》，由科学出版社2022-03出版，作为“十三五”普通高等教育研究生规划教材、创新型现代农林院校研究生系列教材、全国农业专业学位研究生教育指导委员会推荐教材。 该书由中国农业大学校长孙其信院士主编，总体内容比较新，引进大量的 阅读全文
摘要：
目录论文概述论文速读论文方法论文实验论文总结 论文概述 本文主要探讨了第三代测序技术在不同基因组中的组装策略比较。随着长读序列技术的发展，如Pacific Biosciences和Oxford Nanopore技术，组装精度和计算成本得到了显著提高。然而，从头组装仍然存在计算成本高、结果质量差等挑战 阅读全文
摘要：
目录GS架构GS模型GS论文GS工具影响GS因素总结 过去的二十年，GS已被全球动物育种计划广泛采用，因为它有可能提高选择准确性，最大限度地减少表型，缩短周期和增加遗传增益。此外，鉴于GS在提高小麦、玉米和水稻等谷类作物的产量、生物和非生物胁迫耐受性以及品质方面取得了可喜的初步评估结果，因此正在探索 阅读全文
摘要：
现代玉米育种中，提高品种耐密性和种植密度是提高玉米单产的关键措施。玉米密植后群体通风、透光性降低，会引起避荫反应，造成株高和穗位高增加、抗生物和非生物胁迫能力降低、植株抗倒性降低，并最终导致产量损失。因此，培育耐密理想株型玉米是提高玉米耐密性的重要途径。 2023年12月22日，华南农大王海洋教授与 阅读全文